More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3390 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  56.16 
 
 		 586 aa  667    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 579 aa  1213    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.66 
 
 		 564 aa  535  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  31.12 
 
 		 527 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  31.31 
 
 		 525 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  31.31 
 
 		 525 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  31.31 
 
 		 525 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  31.26 
 
 		 529 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  36.85 
 
 		 556 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  31.43 
 
 		 527 aa  279  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.25 
 
 		 557 aa  273  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.24 
 
 		 533 aa  272  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  31.12 
 
 		 528 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  32.69 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  31.12 
 
 		 532 aa  264  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.4 
 
 		 550 aa  257  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.19 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  30.86 
 
 		 521 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 518 aa  249  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  32.06 
 
 		 584 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  31.78 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.26 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  30.65 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  30 
 
 		 563 aa  244  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.12 
 
 		 565 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.89 
 
 		 568 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.44 
 
 		 534 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  30.5 
 
 		 531 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  30.61 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.5 
 
 		 534 aa  233  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 		 572 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.47 
 
 		 524 aa  232  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  30.51 
 
 		 559 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  30.53 
 
 		 583 aa  227  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  29.87 
 
 		 520 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  29.54 
 
 		 540 aa  224  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  29.78 
 
 		 545 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.18 
 
 		 510 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.4 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.13 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  32.43 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.22 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.08 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 516 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.77 
 
 		 523 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  28.72 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.89 
 
 		 520 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  27.92 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  28.92 
 
 		 534 aa  183  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  29.02 
 
 		 470 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  28.06 
 
 		 513 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  27.87 
 
 		 484 aa  173  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  28.34 
 
 		 534 aa  171  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  27.98 
 
 		 546 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  27.08 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.08 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  26.88 
 
 		 484 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  27.08 
 
 		 484 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  27.08 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  27.08 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  27.08 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  25.1 
 
 		 532 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  27.73 
 
 		 531 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  25.48 
 
 		 527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.75 
 
 		 536 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  26.27 
 
 		 532 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  26.87 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  24.55 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  26.76 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.3 
 
 		 470 aa  134  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.45 
 
 		 470 aa  133  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.6 
 
 		 470 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  24.6 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.54 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.45 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.25 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.45 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.45 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  25.6 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.45 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  25.6 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  24.3 
 
 		 459 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.5 
 
 		 473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  23.59 
 
 		 459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  23.79 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.65 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  36.08 
 
 		 572 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.63 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  25.05 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  25.94 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.93 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  23.63 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.19 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  25.28 
 
 		 471 aa  113  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.04 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  24.22 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.22 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>