More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2577 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 520 aa  1025    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  81 
 
 		 521 aa  793    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  60.11 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  54.98 
 
 		 532 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.4 
 
 		 572 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  54.91 
 
 		 521 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.63 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  56.19 
 
 		 545 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  51.32 
 
 		 527 aa  475  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  51.14 
 
 		 529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  53.32 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  53.32 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  53.32 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  53.15 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  53.55 
 
 		 524 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  49.33 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  50.29 
 
 		 531 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.95 
 
 		 534 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  47.96 
 
 		 550 aa  356  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  40.04 
 
 		 556 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.76 
 
 		 533 aa  316  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  37.55 
 
 		 552 aa  305  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  37.87 
 
 		 531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  32.85 
 
 		 563 aa  303  5.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  37.5 
 
 		 531 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  33.51 
 
 		 559 aa  296  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  34.44 
 
 		 583 aa  296  7e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 		 534 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  36.41 
 
 		 584 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.52 
 
 		 565 aa  279  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  34.94 
 
 		 538 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.08 
 
 		 568 aa  269  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.32 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  41.13 
 
 		 546 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 		 554 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.87 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  30.86 
 
 		 586 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  38 
 
 		 467 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  36.31 
 
 		 527 aa  237  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 564 aa  236  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.24 
 
 		 536 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  35.05 
 
 		 465 aa  233  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.69 
 
 		 535 aa  232  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  37.31 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  34.05 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  37.26 
 
 		 470 aa  223  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  37.88 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  33 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  36.01 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  30.79 
 
 		 484 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 484 aa  211  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  30.79 
 
 		 484 aa  210  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.79 
 
 		 484 aa  210  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  30.79 
 
 		 484 aa  210  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.68 
 
 		 510 aa  209  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  30.58 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  30.58 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  30.58 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.88 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  34.75 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.21 
 
 		 516 aa  200  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  28.54 
 
 		 484 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  32.72 
 
 		 517 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  34.21 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.84 
 
 		 523 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  30.64 
 
 		 451 aa  173  6.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  31.25 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.12 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  30.91 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  32.7 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  31.33 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  31.37 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  41.52 
 
 		 572 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  30.57 
 
 		 474 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.41 
 
 		 462 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  29.67 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  26.86 
 
 		 554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  30.28 
 
 		 471 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.64 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 		 470 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  30.5 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.98 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  32.01 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.88 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.94 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.41 
 
 		 482 aa  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  31.3 
 
 		 472 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.34 
 
 		 472 aa  143  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 		 474 aa  143  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  31.46 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.63 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  29 
 
 		 485 aa  140  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.57 
 
 		 473 aa  139  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.51 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>