More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0594 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  78.17 
 
 		 559 aa  888    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 565 aa  1177    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  58.22 
 
 		 531 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  58.6 
 
 		 531 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.95 
 
 		 534 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.52 
 
 		 531 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.44 
 
 		 533 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  49.16 
 
 		 538 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  46.53 
 
 		 583 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  37.04 
 
 		 556 aa  340  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  35.41 
 
 		 532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  34.31 
 
 		 527 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.06 
 
 		 528 aa  294  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  35.93 
 
 		 529 aa  293  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.54 
 
 		 550 aa  290  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  34.01 
 
 		 525 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  34.01 
 
 		 525 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  34.01 
 
 		 525 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  31.54 
 
 		 563 aa  284  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  33.95 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.34 
 
 		 572 aa  281  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.52 
 
 		 518 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  33.81 
 
 		 584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.44 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  34.62 
 
 		 527 aa  273  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.49 
 
 		 531 aa  271  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  34.51 
 
 		 545 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  32.26 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.49 
 
 		 534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  35.38 
 
 		 521 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.18 
 
 		 524 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.89 
 
 		 568 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.55 
 
 		 557 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.05 
 
 		 540 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  33.15 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.12 
 
 		 579 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.04 
 
 		 564 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.63 
 
 		 586 aa  216  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  30.47 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  30.4 
 
 		 546 aa  200  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  29.25 
 
 		 532 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  29.54 
 
 		 531 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.47 
 
 		 554 aa  187  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  30.16 
 
 		 534 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  30.16 
 
 		 502 aa  187  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  28.6 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.88 
 
 		 535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  30.02 
 
 		 470 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  28 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.81 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.69 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 		 523 aa  160  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.29 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  26.1 
 
 		 513 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.25 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  26.42 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  26.42 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  26.42 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.56 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  26.2 
 
 		 484 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 484 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  39.55 
 
 		 532 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  26.44 
 
 		 484 aa  135  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 		 572 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  27.43 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.36 
 
 		 457 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.34 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  25.93 
 
 		 499 aa  114  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  24.36 
 
 		 459 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.15 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.22 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  25.89 
 
 		 465 aa  107  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.93 
 
 		 460 aa  107  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.63 
 
 		 462 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.44 
 
 		 470 aa  107  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  25.49 
 
 		 495 aa  106  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  25.22 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.22 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.62 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.38 
 
 		 473 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  25.22 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.22 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.22 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.4 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.41 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.22 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  24.04 
 
 		 469 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  25 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.22 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.04 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.88 
 
 		 474 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.13 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  22.88 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>