More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1997 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
466 aa  946    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62 
 
 
473 aa  570  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0540  FAD linked oxidase domain protein  60.98 
 
 
470 aa  557  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.299448  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 
465 aa  350  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  41.44 
 
 
454 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  39.62 
 
 
463 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  39.62 
 
 
463 aa  316  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  39.62 
 
 
463 aa  315  9e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  39.62 
 
 
463 aa  315  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  39.62 
 
 
463 aa  315  9e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  44.15 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  39.38 
 
 
463 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  38.66 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.48 
 
 
447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 
461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  39.51 
 
 
457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.19 
 
 
463 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.19 
 
 
463 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.71 
 
 
463 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.47 
 
 
476 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  37.95 
 
 
495 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  37.53 
 
 
472 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  37.7 
 
 
452 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 
469 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  37.24 
 
 
469 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 
469 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.7 
 
 
469 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40 
 
 
462 aa  296  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  36.16 
 
 
472 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.72 
 
 
477 aa  295  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  37.44 
 
 
471 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.01 
 
 
469 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.78 
 
 
469 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  35.93 
 
 
472 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  36.09 
 
 
471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.02 
 
 
470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.48 
 
 
474 aa  289  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  37.32 
 
 
472 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.9 
 
 
464 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.32 
 
 
485 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.52 
 
 
475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.05 
 
 
475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  38.62 
 
 
456 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  36.58 
 
 
473 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.53 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 
474 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.58 
 
 
473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.88 
 
 
467 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  37.23 
 
 
447 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 
469 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.36 
 
 
459 aa  280  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  36.55 
 
 
469 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.55 
 
 
469 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.55 
 
 
469 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  37.44 
 
 
474 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.55 
 
 
469 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  36.55 
 
 
469 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  36.55 
 
 
469 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  36.55 
 
 
469 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  36.11 
 
 
474 aa  279  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.71 
 
 
459 aa  278  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  36.84 
 
 
457 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  36.32 
 
 
469 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  36.1 
 
 
474 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.39 
 
 
460 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.6 
 
 
457 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  37.22 
 
 
474 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.89 
 
 
457 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.04 
 
 
473 aa  276  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.38 
 
 
460 aa  275  9e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.73 
 
 
488 aa  275  9e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  35.43 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.58 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.55 
 
 
497 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.55 
 
 
497 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.55 
 
 
497 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.55 
 
 
497 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.55 
 
 
477 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.91 
 
 
460 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.04 
 
 
474 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.28 
 
 
470 aa  273  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.55 
 
 
497 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.63 
 
 
492 aa  272  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  33.98 
 
 
461 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  38.15 
 
 
465 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  35.31 
 
 
497 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  35.07 
 
 
459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  38.42 
 
 
472 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.05 
 
 
457 aa  270  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.91 
 
 
482 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  34.83 
 
 
459 aa  269  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  34.94 
 
 
601 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.83 
 
 
470 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  33.89 
 
 
461 aa  268  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  35.48 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  35.53 
 
 
462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.03 
 
 
459 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.35 
 
 
462 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.64 
 
 
472 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  36.82 
 
 
468 aa  266  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>