More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3935 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
465 aa  939    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.41 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0540  FAD linked oxidase domain protein  46.3 
 
 
470 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.299448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  42.57 
 
 
463 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.86 
 
 
466 aa  350  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  42.35 
 
 
463 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  42.35 
 
 
463 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  42.35 
 
 
463 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  42.13 
 
 
463 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  41.37 
 
 
463 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  41.76 
 
 
463 aa  345  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  41.19 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  41.37 
 
 
463 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.87 
 
 
463 aa  338  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.52 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  40.54 
 
 
454 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.26 
 
 
476 aa  318  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  40.9 
 
 
472 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  41.8 
 
 
472 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  42.24 
 
 
462 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  40.86 
 
 
495 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.27 
 
 
488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
472 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.32 
 
 
474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  39.95 
 
 
478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  40.77 
 
 
473 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 
469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.36 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  40.13 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  40.13 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  39.05 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.5 
 
 
464 aa  303  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  39.5 
 
 
453 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.41 
 
 
473 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  38.83 
 
 
471 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  39.28 
 
 
471 aa  302  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.28 
 
 
485 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.64 
 
 
474 aa  296  6e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  40 
 
 
474 aa  296  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 
469 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 
469 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.91 
 
 
470 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  39.59 
 
 
474 aa  294  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  39.69 
 
 
469 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.95 
 
 
470 aa  293  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.87 
 
 
457 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 
474 aa  292  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  40.18 
 
 
469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  40.18 
 
 
469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  40.18 
 
 
469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  40.18 
 
 
469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  40.18 
 
 
469 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  40.18 
 
 
469 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  40.18 
 
 
469 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 
467 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 
460 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.41 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  37.53 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.69 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  36.73 
 
 
456 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  36.28 
 
 
474 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.99 
 
 
459 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.64 
 
 
447 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.46 
 
 
497 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.46 
 
 
497 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  38.83 
 
 
499 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.89 
 
 
457 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  38.24 
 
 
497 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.95 
 
 
457 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.24 
 
 
477 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.86 
 
 
473 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.24 
 
 
497 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.24 
 
 
497 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  38.89 
 
 
457 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.24 
 
 
497 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  40.63 
 
 
468 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  36.93 
 
 
465 aa  277  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 
447 aa  276  7e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  40.09 
 
 
474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  35.87 
 
 
466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  39.4 
 
 
474 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  37.05 
 
 
462 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1410  oxidoreductase, FAD-binding  36.99 
 
 
468 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.88 
 
 
475 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2410  FAD linked oxidase-like  39.38 
 
 
474 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  37.29 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.07 
 
 
469 aa  269  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  35.95 
 
 
457 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.11 
 
 
482 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.44 
 
 
477 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  35.51 
 
 
472 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36 
 
 
475 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 
469 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  39.28 
 
 
472 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55040  d-lactate dehydrogenase  36.12 
 
 
506 aa  265  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1366  oxidoreductase, FAD-binding  37.21 
 
 
465 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  38.12 
 
 
475 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.73 
 
 
461 aa  261  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 
470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>