100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3803 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
493 aa  994    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  65.95 
 
 
459 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.16 
 
 
459 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.95 
 
 
459 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  64.94 
 
 
481 aa  606  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  63.62 
 
 
460 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.96 
 
 
463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  62.88 
 
 
466 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.9 
 
 
463 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.07 
 
 
460 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  58.71 
 
 
455 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.94 
 
 
460 aa  525  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  56.54 
 
 
470 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  54.23 
 
 
481 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.39 
 
 
459 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.25 
 
 
456 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  52.72 
 
 
479 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.8 
 
 
447 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  50.33 
 
 
452 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  43.32 
 
 
451 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  29.27 
 
 
497 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  22.77 
 
 
578 aa  94  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 
491 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  31.9 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.1 
 
 
453 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.58 
 
 
462 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  35.43 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.54 
 
 
463 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  34.68 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.68 
 
 
462 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.68 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  35.29 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  29.73 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  35.9 
 
 
461 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 
460 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  33.63 
 
 
459 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  36.61 
 
 
499 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.04 
 
 
462 aa  57  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  34.19 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.46 
 
 
472 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  25.81 
 
 
461 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  29.66 
 
 
473 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  33.33 
 
 
461 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  30.97 
 
 
449 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 
481 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.19 
 
 
461 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  22.49 
 
 
447 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 
464 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.64 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.62 
 
 
472 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.39 
 
 
473 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
475 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  26.67 
 
 
476 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  28.57 
 
 
499 aa  50.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  24.09 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  27.69 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.69 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  35.29 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.69 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.97 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  24.09 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  28.47 
 
 
478 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 
479 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  36.52 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.77 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  36.57 
 
 
465 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  31.25 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  29.82 
 
 
596 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  30.36 
 
 
479 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.81 
 
 
474 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  35.16 
 
 
476 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.22 
 
 
485 aa  47  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.7 
 
 
656 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  24.8 
 
 
474 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  24.06 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  34.45 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  27.42 
 
 
466 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.19 
 
 
906 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 
461 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.53 
 
 
475 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 
425 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  25.83 
 
 
471 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.55 
 
 
465 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  31.9 
 
 
469 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  25.83 
 
 
468 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  30.47 
 
 
446 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  27.55 
 
 
475 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  25.83 
 
 
478 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  25.83 
 
 
478 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  27.5 
 
 
499 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.45 
 
 
501 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  31.2 
 
 
461 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  28.43 
 
 
572 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
479 aa  43.9  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.95 
 
 
482 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  25 
 
 
471 aa  43.5  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
470 aa  43.5  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.57 
 
 
429 aa  43.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  26.02 
 
 
481 aa  43.1  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  27.07 
 
 
471 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>