101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0966 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  92.61 
 
 
460 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
460 aa  926    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.49 
 
 
459 aa  567  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  60.96 
 
 
455 aa  558  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  57.08 
 
 
460 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  59.21 
 
 
459 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.21 
 
 
459 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.43 
 
 
459 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  57.46 
 
 
481 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  59.16 
 
 
466 aa  518  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.31 
 
 
456 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  56.02 
 
 
470 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.17 
 
 
463 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  54.9 
 
 
481 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  59.07 
 
 
493 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.87 
 
 
463 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  53.83 
 
 
452 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  54.77 
 
 
479 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.75 
 
 
447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  44.39 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  30.17 
 
 
497 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  22.66 
 
 
578 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  31.39 
 
 
491 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  32.89 
 
 
378 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.47 
 
 
465 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  31.13 
 
 
473 aa  57  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.75 
 
 
453 aa  56.6  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.95 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.97 
 
 
463 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  33.66 
 
 
447 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  26.54 
 
 
481 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  29.51 
 
 
461 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.93 
 
 
461 aa  53.9  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.63 
 
 
483 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  34.96 
 
 
499 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.37 
 
 
459 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.34 
 
 
475 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.15 
 
 
472 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 
462 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 
460 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.36 
 
 
461 aa  53.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  25.47 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  32.81 
 
 
468 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  32.03 
 
 
479 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  30.19 
 
 
441 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  31.02 
 
 
466 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 
476 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  32.81 
 
 
462 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.03 
 
 
462 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  32.03 
 
 
461 aa  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.87 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  31.71 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  33.56 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  26.17 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
999 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  31.25 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.56 
 
 
656 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  24.86 
 
 
442 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  26.17 
 
 
456 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  27.34 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  30.61 
 
 
447 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.32 
 
 
485 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  27.05 
 
 
456 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.05 
 
 
456 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.05 
 
 
456 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  27.22 
 
 
499 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 
473 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.32 
 
 
995 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  31.43 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.03 
 
 
999 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  27.2 
 
 
474 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.04 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  25.44 
 
 
492 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  26.9 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  25 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  23.13 
 
 
440 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  26.11 
 
 
466 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  30.26 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  32.52 
 
 
456 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  24.02 
 
 
437 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  30.7 
 
 
596 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  21.64 
 
 
1015 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.54 
 
 
478 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.09 
 
 
480 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.47 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.24 
 
 
485 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  23.21 
 
 
437 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.85 
 
 
492 aa  43.9  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.14 
 
 
490 aa  43.9  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.43 
 
 
488 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.43 
 
 
488 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  30.67 
 
 
448 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  26.9 
 
 
499 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  32.46 
 
 
439 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 
465 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>