64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5005 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
447 aa  902    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  58.39 
 
 
455 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.41 
 
 
459 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.35 
 
 
456 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.63 
 
 
459 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  55.63 
 
 
459 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.63 
 
 
460 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  54.01 
 
 
481 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.87 
 
 
460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  54.81 
 
 
452 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.72 
 
 
459 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.29 
 
 
463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  54.85 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.85 
 
 
463 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  55.26 
 
 
470 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  52.18 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  54 
 
 
481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  53.22 
 
 
466 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  54.8 
 
 
493 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  44.44 
 
 
451 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  28.27 
 
 
497 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  24.7 
 
 
578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  27.72 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.09 
 
 
441 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.62 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.9 
 
 
462 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  24.81 
 
 
456 aa  56.6  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
378 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  24.81 
 
 
456 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.51 
 
 
472 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.5 
 
 
462 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  32.5 
 
 
462 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.5 
 
 
462 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  29.17 
 
 
461 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.66 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  28.47 
 
 
444 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.56 
 
 
483 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  30.08 
 
 
421 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  32.45 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.36 
 
 
485 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.81 
 
 
656 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 
481 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  27.91 
 
 
499 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.29 
 
 
482 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.12 
 
 
481 aa  47  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  27.36 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  31.3 
 
 
474 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.41 
 
 
761 aa  46.6  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  25.71 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  29.17 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.53 
 
 
488 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.06 
 
 
488 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  29.32 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.08 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  27.48 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.97 
 
 
462 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.47 
 
 
499 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1990  FAD linked oxidase domain protein  34.75 
 
 
424 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  25.95 
 
 
1015 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  28.14 
 
 
461 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.71 
 
 
496 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>