110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1076 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  927    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  92.61 
 
 		 460 aa  868    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.71 
 
 		 459 aa  567  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  61.84 
 
 		 455 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  58.21 
 
 		 460 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.96 
 
 		 459 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  60.75 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.75 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  58.33 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  59.6 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.65 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.7 
 
 		 463 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  56.89 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.96 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  55.77 
 
 		 481 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  59.07 
 
 		 493 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  54.05 
 
 		 452 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  54.07 
 
 		 479 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.63 
 
 		 447 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  44.39 
 
 		 451 aa  352  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  28.67 
 
 		 497 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  23.4 
 
 		 578 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  30.6 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.54 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.54 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.93 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  34.75 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 		 463 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.65 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  29.11 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.9 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  29.51 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  29.32 
 
 		 447 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  28.96 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.97 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  27.89 
 
 		 476 aa  53.5  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.48 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.83 
 
 		 482 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  33.86 
 
 		 468 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  33.59 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  27.17 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  33.07 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  23.44 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.44 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.44 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.96 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.29 
 
 		 656 aa  50.8  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  27.22 
 
 		 499 aa  50.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  33.04 
 
 		 462 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 		 462 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  34.96 
 
 		 499 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.37 
 
 		 485 aa  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.88 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  33.59 
 
 		 462 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  30.71 
 
 		 473 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  26.63 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  31.5 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  26.63 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  31.3 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  31.97 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  31.71 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.86 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  29.75 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  26.64 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.04 
 
 		 499 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  24.44 
 
 		 456 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  24.39 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  24.44 
 
 		 456 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.48 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  27.2 
 
 		 474 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.56 
 
 		 490 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  25.6 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.68 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  25.44 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  25.44 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 999 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  25.77 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  23.35 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  24.2 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  24.2 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.87 
 
 		 995 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  24.84 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  36.97 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  31.82 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.59 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  25.44 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  27.59 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  32.08 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  26.9 
 
 		 499 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.59 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  29.13 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  25.6 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  27.59 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.54 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>