104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0429 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  71.68 
 
 
459 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.68 
 
 
459 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.46 
 
 
459 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
460 aa  944    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  72.79 
 
 
481 aa  691    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.11 
 
 
463 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.47 
 
 
463 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  67.1 
 
 
466 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  63.62 
 
 
493 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.21 
 
 
460 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.08 
 
 
460 aa  541  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  60.71 
 
 
455 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  58.73 
 
 
481 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.44 
 
 
459 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  56.8 
 
 
470 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.73 
 
 
456 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  54.97 
 
 
479 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  52.53 
 
 
452 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.58 
 
 
447 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  42.79 
 
 
451 aa  360  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  26.88 
 
 
497 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  22.94 
 
 
578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.61 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.67 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  28.92 
 
 
491 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  35 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  31.67 
 
 
461 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
462 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  34.15 
 
 
481 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 
378 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  32.48 
 
 
462 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 
462 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 
462 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  29.92 
 
 
474 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  28.33 
 
 
456 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.33 
 
 
456 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 
460 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.33 
 
 
456 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  28.35 
 
 
476 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.88 
 
 
462 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  34.43 
 
 
478 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.66 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  26.45 
 
 
441 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 
459 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  27.69 
 
 
440 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.24 
 
 
483 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.57 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  25.71 
 
 
443 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.38 
 
 
482 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  25.83 
 
 
761 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.36 
 
 
596 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  25.86 
 
 
449 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  26.28 
 
 
447 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  29.08 
 
 
432 aa  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.92 
 
 
460 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  25.5 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  30.51 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.7 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  31.9 
 
 
499 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  25.14 
 
 
466 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.8 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  24.8 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  30.86 
 
 
520 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 
437 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.8 
 
 
478 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.8 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  24.8 
 
 
478 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.8 
 
 
478 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  26.19 
 
 
425 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  31.5 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.17 
 
 
490 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.61 
 
 
461 aa  47  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  24.6 
 
 
475 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  32.2 
 
 
465 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.35 
 
 
481 aa  46.6  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.54 
 
 
429 aa  46.6  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  29.86 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.29 
 
 
656 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  29.13 
 
 
462 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  25.52 
 
 
461 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.38 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  26.77 
 
 
473 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.29 
 
 
473 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.28 
 
 
516 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.58 
 
 
523 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  22.86 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  25.15 
 
 
448 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  22.86 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  28.35 
 
 
462 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  25.97 
 
 
499 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  23.02 
 
 
478 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.29 
 
 
475 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2410  FAD linked oxidase-like  29.21 
 
 
474 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  24.32 
 
 
478 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.03 
 
 
445 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
472 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.35 
 
 
464 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  28.8 
 
 
479 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>