85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2161 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  962    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  72.28 
 
 		 481 aa  691    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  63.97 
 
 		 455 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.13 
 
 		 456 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  60.17 
 
 		 452 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  60.52 
 
 		 479 aa  534  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.77 
 
 		 459 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.33 
 
 		 459 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  57.33 
 
 		 459 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.89 
 
 		 460 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  56.8 
 
 		 460 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.02 
 
 		 460 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  57.78 
 
 		 481 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  57.27 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.71 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.18 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.83 
 
 		 459 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  56.54 
 
 		 493 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.32 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  48.08 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  28.66 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  26.47 
 
 		 578 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  29.83 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  30.11 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  27.49 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.59 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  29.23 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.13 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  32.82 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.5 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.5 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  27.5 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  26.79 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.27 
 
 		 453 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.23 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.46 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  24.39 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  25.41 
 
 		 461 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30.08 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.34 
 
 		 475 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  27.42 
 
 		 462 aa  50.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  26.72 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  25.6 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  26.07 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  30.83 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  30.61 
 
 		 481 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  28.57 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  32.43 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.7 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.79 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  30.08 
 
 		 462 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  25.4 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.12 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.37 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  24.84 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  25.62 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.28 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 464 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  29.13 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  29.77 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  25.53 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  30.32 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.43 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  29.33 
 
 		 476 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  27.03 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  21.71 
 
 		 443 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  27.15 
 
 		 474 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  30.52 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  29.63 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  29.63 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 437 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 499 aa  43.5  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11243  FAD/FMN-containing isoamyl alcohol oxidase MreA (AFU_orthologue; AFUA_6G03620)  31.97 
 
 		 562 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.549229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>