More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7235 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
491 aa  964    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.44 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  40.58 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.96 
 
 
462 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  41.54 
 
 
378 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  28.6 
 
 
447 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  28.04 
 
 
456 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  27.14 
 
 
456 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3126  FAD linked oxidase domain protein  40.37 
 
 
147 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  36.26 
 
 
461 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.54 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.71 
 
 
469 aa  93.6  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  32.7 
 
 
499 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  35.11 
 
 
468 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  37.75 
 
 
465 aa  90.1  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  32.61 
 
 
474 aa  88.2  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  32.74 
 
 
500 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  35.47 
 
 
462 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  33.16 
 
 
462 aa  87.4  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.68 
 
 
465 aa  86.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.17 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  35.29 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  38.65 
 
 
596 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  30.27 
 
 
479 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  31.35 
 
 
461 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  30.92 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.15 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  32.54 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.96 
 
 
506 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  29.69 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 
989 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  31.75 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.08 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.18 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  33.87 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  31.95 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  30.45 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
507 aa  80.1  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.73 
 
 
462 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.68 
 
 
459 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  35.76 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  32.28 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  31.96 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  29.76 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.95 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.35 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  27.65 
 
 
466 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 
463 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 
496 aa  77  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  28.8 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  32.83 
 
 
497 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.85 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  29.46 
 
 
462 aa  76.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 
469 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.85 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.05 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  33.18 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  30.97 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  28.98 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  30.43 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.44 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  25.27 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.06 
 
 
705 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  29.72 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  24.91 
 
 
497 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.53 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  29.61 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  33.14 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.14 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.14 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  30.72 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.91 
 
 
497 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  34.56 
 
 
461 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  28.45 
 
 
503 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  29.85 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.72 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  35.98 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  36.65 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  31.18 
 
 
764 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  28.74 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.5 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.5 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.66 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  29.94 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  29.39 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.85 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.85 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  30.56 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  30.56 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  28.89 
 
 
484 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  34.27 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.32 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1781  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.03 
 
 
501 aa  71.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.31 
 
 
488 aa  71.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>