More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0955 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  939    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  98.03 
 
 
456 aa  923    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  31.47 
 
 
447 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.13 
 
 
483 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  28.04 
 
 
491 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  27.15 
 
 
441 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.29 
 
 
462 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  26.17 
 
 
378 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  30.24 
 
 
470 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 
457 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.23 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.88 
 
 
481 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.64 
 
 
989 aa  75.1  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.25 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.73 
 
 
468 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  24.45 
 
 
499 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  26.23 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.88 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.48 
 
 
470 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  25.66 
 
 
499 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  26.2 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  23.89 
 
 
499 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.96 
 
 
470 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  23.58 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  23.58 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.82 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  24.66 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  26.14 
 
 
1000 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  25.48 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.48 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.48 
 
 
470 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.48 
 
 
470 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  25.48 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.24 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.48 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.48 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  25.54 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  29.21 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  24.89 
 
 
499 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  27.71 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  27.78 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  25.83 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  25.35 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  29.35 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  25 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.95 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  25.4 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.36 
 
 
887 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  29.27 
 
 
473 aa  67  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.18 
 
 
890 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  22.66 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  30 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.29 
 
 
501 aa  66.6  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 
464 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  29.51 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  23.69 
 
 
457 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.2 
 
 
447 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  22.66 
 
 
471 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  25.5 
 
 
459 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  28.8 
 
 
474 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.66 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  25.11 
 
 
460 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.14 
 
 
485 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.12 
 
 
457 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.8 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.32 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 
474 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.35 
 
 
511 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.32 
 
 
488 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  22.88 
 
 
478 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  22.83 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  24.7 
 
 
485 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.64 
 
 
490 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 
996 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 
466 aa  64.7  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.9 
 
 
467 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  22.44 
 
 
471 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  25 
 
 
462 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  26.64 
 
 
461 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  26.64 
 
 
461 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  28.5 
 
 
478 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.72 
 
 
474 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  23.24 
 
 
474 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.87 
 
 
488 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  24.61 
 
 
498 aa  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  26.63 
 
 
1014 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  26.4 
 
 
453 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  28.16 
 
 
466 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.8 
 
 
470 aa  63.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.2 
 
 
475 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0410  hypothetical protein  22.27 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.622003  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0368  putative oxidoreductase, FAD binding  25 
 
 
480 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  22.75 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  24.36 
 
 
1015 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  19.67 
 
 
462 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  19.75 
 
 
462 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  29.14 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  29.14 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.2 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  26.07 
 
 
462 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>