More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1082 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  45.89 
 
 
1024 aa  977    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  100 
 
 
1015 aa  2095    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  45.64 
 
 
1024 aa  986    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  62.19 
 
 
1015 aa  1361    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  31.23 
 
 
409 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  31.6 
 
 
415 aa  183  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  31.25 
 
 
388 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.41 
 
 
383 aa  161  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  30.34 
 
 
386 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  23.3 
 
 
1000 aa  160  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0980  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.68 
 
 
440 aa  160  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.99 
 
 
385 aa  158  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.61 
 
 
383 aa  157  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  29.21 
 
 
739 aa  150  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.5 
 
 
989 aa  148  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  29.53 
 
 
390 aa  147  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.68 
 
 
743 aa  145  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0771  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.5 
 
 
406 aa  144  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0497692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  28.21 
 
 
659 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.06 
 
 
698 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.61 
 
 
722 aa  142  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.72 
 
 
663 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.97 
 
 
663 aa  141  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  28.96 
 
 
703 aa  140  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  29.63 
 
 
655 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  24.88 
 
 
716 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  27.44 
 
 
678 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  29.38 
 
 
727 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  28.36 
 
 
629 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.62 
 
 
411 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  28.36 
 
 
703 aa  139  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  28.36 
 
 
703 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  28.36 
 
 
703 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  28.36 
 
 
703 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  28.36 
 
 
703 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  28.36 
 
 
703 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  28.36 
 
 
703 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.88 
 
 
717 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  31.07 
 
 
372 aa  138  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  31.33 
 
 
658 aa  137  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.89 
 
 
721 aa  137  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.19 
 
 
699 aa  137  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  29.24 
 
 
752 aa  137  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  29.08 
 
 
730 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  24.7 
 
 
699 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  29.43 
 
 
356 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  28.06 
 
 
703 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  28.06 
 
 
703 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.32 
 
 
737 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  28.57 
 
 
652 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.81 
 
 
656 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  27.55 
 
 
661 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.47 
 
 
387 aa  134  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.38 
 
 
713 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.02 
 
 
656 aa  132  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.8 
 
 
655 aa  131  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.46 
 
 
762 aa  131  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.13 
 
 
683 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  25 
 
 
716 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.19 
 
 
664 aa  128  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  25.55 
 
 
446 aa  128  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.19 
 
 
664 aa  127  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  29.13 
 
 
1033 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
658 aa  126  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  26.42 
 
 
1388 aa  125  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0952  hypothetical protein  29.31 
 
 
365 aa  125  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3062  FAD linked oxidase-like protein  27.22 
 
 
387 aa  125  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  28.87 
 
 
375 aa  125  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.12 
 
 
658 aa  124  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  27.57 
 
 
661 aa  124  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.8 
 
 
461 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  27.68 
 
 
692 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  27.85 
 
 
472 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.94 
 
 
748 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  25.61 
 
 
683 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0768  hypothetical protein  27.68 
 
 
385 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  26.97 
 
 
732 aa  121  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.56 
 
 
694 aa  120  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1499  heterodisulfide reductase, subunit D  26.41 
 
 
382 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0669416  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  26.69 
 
 
718 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.31 
 
 
641 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  26.35 
 
 
688 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.5 
 
 
676 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.08 
 
 
470 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.27 
 
 
460 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.54 
 
 
699 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.51 
 
 
470 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  30.52 
 
 
663 aa  115  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.86 
 
 
434 aa  115  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
467 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  24.42 
 
 
441 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  24.49 
 
 
727 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.58 
 
 
433 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  26.51 
 
 
470 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.62 
 
 
712 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.51 
 
 
470 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  26.51 
 
 
470 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.17 
 
 
459 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  25.82 
 
 
412 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  27.5 
 
 
494 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>