More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2889 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
1000 aa  2039    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.32 
 
 
989 aa  1312    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  23.59 
 
 
1024 aa  195  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  23.32 
 
 
1024 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  22.96 
 
 
1015 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  22.75 
 
 
1015 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.3 
 
 
890 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.78 
 
 
456 aa  110  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  24.72 
 
 
473 aa  108  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.26 
 
 
464 aa  108  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.87 
 
 
474 aa  108  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1410  oxidoreductase, FAD-binding  24.8 
 
 
468 aa  107  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  25.84 
 
 
466 aa  107  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  26.19 
 
 
483 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.12 
 
 
469 aa  106  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.27 
 
 
473 aa  105  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  23.73 
 
 
474 aa  105  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  32.69 
 
 
498 aa  105  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.22 
 
 
484 aa  105  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 
475 aa  105  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  23.87 
 
 
474 aa  104  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.93 
 
 
470 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.7 
 
 
470 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 
457 aa  102  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.98 
 
 
453 aa  101  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  23.98 
 
 
472 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  31.35 
 
 
472 aa  101  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.82 
 
 
887 aa  101  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.85 
 
 
460 aa  101  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.35 
 
 
475 aa  101  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.52 
 
 
473 aa  101  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 
469 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.81 
 
 
460 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.96 
 
 
470 aa  100  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 
459 aa  99.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  30.1 
 
 
457 aa  99.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.15 
 
 
470 aa  99.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
492 aa  99.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  23.82 
 
 
474 aa  99.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  24.34 
 
 
472 aa  99.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  29.04 
 
 
478 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  30.1 
 
 
459 aa  99  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0540  FAD linked oxidase domain protein  30.8 
 
 
470 aa  98.6  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.299448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  31.02 
 
 
459 aa  98.6  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  24.32 
 
 
474 aa  98.2  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.14 
 
 
457 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  33.97 
 
 
470 aa  98.2  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.54 
 
 
470 aa  98.2  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.97 
 
 
470 aa  98.2  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  32.04 
 
 
459 aa  98.2  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1366  oxidoreductase, FAD-binding  22.92 
 
 
465 aa  98.2  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.14 
 
 
457 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.14 
 
 
457 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  32.52 
 
 
459 aa  97.8  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  33.97 
 
 
470 aa  97.8  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.24 
 
 
467 aa  98.2  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  33.97 
 
 
470 aa  97.8  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.02 
 
 
471 aa  97.8  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  33.49 
 
 
470 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.49 
 
 
470 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.49 
 
 
470 aa  97.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.49 
 
 
470 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  23.14 
 
 
475 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  23.89 
 
 
472 aa  96.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  23.14 
 
 
475 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  25.74 
 
 
455 aa  96.3  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  32.37 
 
 
461 aa  96.3  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.49 
 
 
470 aa  96.3  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  23.94 
 
 
495 aa  96.3  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  30.25 
 
 
454 aa  96.3  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  24.39 
 
 
472 aa  95.9  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.01 
 
 
470 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  30.25 
 
 
466 aa  95.5  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.58 
 
 
488 aa  95.1  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  30.45 
 
 
563 aa  95.1  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.93 
 
 
485 aa  94.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  23.36 
 
 
473 aa  94.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  28.97 
 
 
468 aa  94.4  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.88 
 
 
453 aa  94  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.51 
 
 
472 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.6 
 
 
485 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.99 
 
 
474 aa  94.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.75 
 
 
457 aa  94  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0568  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 
504 aa  94  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  35 
 
 
455 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.26 
 
 
479 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  22.05 
 
 
472 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  31.96 
 
 
492 aa  93.2  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.27 
 
 
468 aa  93.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  29.71 
 
 
453 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.29 
 
 
497 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 
409 aa  92.8  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.58 
 
 
459 aa  92.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  33.65 
 
 
461 aa  92.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.23 
 
 
477 aa  92.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  25.16 
 
 
469 aa  92  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.05 
 
 
466 aa  92  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55040  d-lactate dehydrogenase  27.78 
 
 
506 aa  92  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  36.61 
 
 
443 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  36.61 
 
 
443 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>