128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2434 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  926    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  77.56 
 
 
452 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  68.16 
 
 
455 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  62.58 
 
 
481 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  64.13 
 
 
470 aa  568  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  61.56 
 
 
479 aa  544  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.65 
 
 
460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.31 
 
 
460 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.04 
 
 
459 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.55 
 
 
459 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  57.33 
 
 
459 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.33 
 
 
459 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  54.73 
 
 
460 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.21 
 
 
463 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  55.1 
 
 
466 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.25 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.78 
 
 
447 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  52.62 
 
 
481 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  53.25 
 
 
493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  47.67 
 
 
451 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  28.76 
 
 
497 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  25.87 
 
 
578 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 
491 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  31.03 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  28.28 
 
 
441 aa  63.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.28 
 
 
453 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  31.09 
 
 
456 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.09 
 
 
456 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.09 
 
 
456 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 
443 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.09 
 
 
463 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.62 
 
 
462 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  29.01 
 
 
474 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.39 
 
 
468 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  34.09 
 
 
442 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  27.73 
 
 
461 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.21 
 
 
433 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  26.89 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  26.89 
 
 
456 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  31.09 
 
 
476 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  22.33 
 
 
471 aa  54.7  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  22.33 
 
 
478 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22.33 
 
 
478 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.33 
 
 
478 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 
475 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.38 
 
 
478 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.38 
 
 
471 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  28.43 
 
 
481 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.89 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  24.38 
 
 
478 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.98 
 
 
475 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  28.66 
 
 
499 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  24.38 
 
 
478 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.9 
 
 
460 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  32.03 
 
 
462 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 
462 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  19.73 
 
 
483 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.38 
 
 
490 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  25.44 
 
 
447 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.17 
 
 
462 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  27.89 
 
 
457 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  27.89 
 
 
457 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.81 
 
 
445 aa  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 
466 aa  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  28.95 
 
 
499 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 
425 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  33.05 
 
 
468 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  28.03 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  26.06 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  25.31 
 
 
761 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.56 
 
 
945 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  28.03 
 
 
499 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.03 
 
 
459 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  28.67 
 
 
499 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.58 
 
 
461 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 
462 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  23.84 
 
 
484 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  28.03 
 
 
497 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.4 
 
 
461 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  29.55 
 
 
517 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  32.14 
 
 
1023 aa  47  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  27.04 
 
 
447 aa  46.6  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.19 
 
 
485 aa  46.6  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  26.67 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.97 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.36 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.8 
 
 
656 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  30.72 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.67 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  31.3 
 
 
457 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  28.65 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.59 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  30.95 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  33.6 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  28.48 
 
 
499 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>