More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1400 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  48.71 
 
 		 1014 aa  907    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.58 
 
 		 1023 aa  1308    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.36 
 
 		 978 aa  659    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  50.68 
 
 		 1032 aa  939    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  63.35 
 
 		 1024 aa  1270    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1023 aa  2073    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  63.45 
 
 		 1055 aa  1294    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  61.72 
 
 		 1070 aa  1251    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.44 
 
 		 1015 aa  1327    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.51 
 
 		 976 aa  656    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.06 
 
 		 1035 aa  1257    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  48.01 
 
 		 996 aa  899    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 		 973 aa  602  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  37.84 
 
 		 952 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.91 
 
 		 1007 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.36 
 
 		 962 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.37 
 
 		 1038 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.04 
 
 		 983 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  35.1 
 
 		 1007 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.43 
 
 		 1005 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.12 
 
 		 991 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.43 
 
 		 989 aa  538  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  35.21 
 
 		 973 aa  537  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.07 
 
 		 995 aa  537  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.94 
 
 		 984 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  35.87 
 
 		 1024 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.33 
 
 		 961 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  35.98 
 
 		 974 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.88 
 
 		 990 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.92 
 
 		 990 aa  512  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  32.02 
 
 		 975 aa  511  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.78 
 
 		 990 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.32 
 
 		 983 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.91 
 
 		 976 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.02 
 
 		 966 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  34.2 
 
 		 1015 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.58 
 
 		 977 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.59 
 
 		 1009 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.76 
 
 		 1032 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.81 
 
 		 968 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.77 
 
 		 1046 aa  492  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.48 
 
 		 971 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  33.87 
 
 		 984 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  34.23 
 
 		 1013 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.13 
 
 		 1025 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 		 976 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.66 
 
 		 1025 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  30.96 
 
 		 967 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.82 
 
 		 1034 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  36.04 
 
 		 1050 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  35.44 
 
 		 1052 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.86 
 
 		 1022 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  31.9 
 
 		 967 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 999 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  35.71 
 
 		 1050 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  34.51 
 
 		 987 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.72 
 
 		 1031 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 		 1011 aa  469  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.56 
 
 		 1037 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  29.69 
 
 		 930 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.83 
 
 		 999 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  33.57 
 
 		 1043 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.23 
 
 		 1000 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.1 
 
 		 945 aa  436  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.69 
 
 		 950 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.96 
 
 		 973 aa  419  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  33.54 
 
 		 975 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  33.2 
 
 		 976 aa  409  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  27.55 
 
 		 1002 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  27.55 
 
 		 1006 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.21 
 
 		 989 aa  402  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  32.94 
 
 		 985 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 948 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.94 
 
 		 1024 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.68 
 
 		 1013 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.26 
 
 		 947 aa  386  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  26.86 
 
 		 1013 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.97 
 
 		 995 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  31.79 
 
 		 949 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.4 
 
 		 1013 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.6 
 
 		 997 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.84 
 
 		 1013 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.94 
 
 		 1013 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 1028 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  33 
 
 		 894 aa  373  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.75 
 
 		 1023 aa  373  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.84 
 
 		 1013 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.42 
 
 		 906 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.36 
 
 		 1023 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  30.14 
 
 		 1010 aa  365  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2071  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.07 
 
 		 1007 aa  365  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.999206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.99 
 
 		 1006 aa  365  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 1013 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2755  FAD linked oxidase domain protein  26.62 
 
 		 1017 aa  363  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.190253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 		 1026 aa  363  9e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  26.63 
 
 		 1016 aa  363  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.35 
 
 		 1013 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.31 
 
 		 974 aa  361  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.25 
 
 		 1013 aa  361  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.55 
 
 		 944 aa  360  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>