99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2272 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
440 aa  906    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  62.7 
 
 
438 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  62.99 
 
 
438 aa  548  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  64.07 
 
 
438 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  57.64 
 
 
438 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  52.26 
 
 
437 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.19 
 
 
447 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  46.44 
 
 
432 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  49.5 
 
 
432 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  46.52 
 
 
444 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.52 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.87 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.81 
 
 
435 aa  349  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.92 
 
 
433 aa  341  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.88 
 
 
432 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  46.29 
 
 
436 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  42.66 
 
 
452 aa  326  6e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  40.05 
 
 
430 aa  323  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  45.28 
 
 
433 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  40.89 
 
 
443 aa  315  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.2 
 
 
433 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.34 
 
 
441 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  38.97 
 
 
436 aa  292  6e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  41.32 
 
 
440 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  42.14 
 
 
444 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.71 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  40.35 
 
 
457 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  40.35 
 
 
457 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  38.86 
 
 
468 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  41.94 
 
 
442 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  44.97 
 
 
472 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 
444 aa  276  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  42.18 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  41.84 
 
 
464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.84 
 
 
462 aa  270  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  41.01 
 
 
452 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  41.2 
 
 
455 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  41.12 
 
 
432 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.64 
 
 
453 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 
425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.02 
 
 
472 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  36.46 
 
 
461 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.65 
 
 
456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  36.65 
 
 
456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.65 
 
 
456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  34.75 
 
 
474 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  33.79 
 
 
481 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.3 
 
 
463 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  35.11 
 
 
476 aa  206  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  33.75 
 
 
431 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  33.5 
 
 
431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.72 
 
 
445 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.29 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  26.32 
 
 
475 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.74 
 
 
490 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  30.07 
 
 
434 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  27.22 
 
 
478 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  30.33 
 
 
471 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  30.33 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  29.41 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  30.33 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  30.33 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  30.33 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  27.22 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  30.33 
 
 
468 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  30.43 
 
 
432 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  28.26 
 
 
441 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  26.39 
 
 
578 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  29.71 
 
 
433 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.01 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  27.67 
 
 
436 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  29.41 
 
 
452 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  28.88 
 
 
441 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  28.11 
 
 
436 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  19.81 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  27.47 
 
 
473 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
378 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  26.44 
 
 
437 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.79 
 
 
429 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  28.57 
 
 
438 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 
456 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 
462 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.14 
 
 
470 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  26.36 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
474 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  26.07 
 
 
428 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  29.58 
 
 
425 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  25.58 
 
 
574 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  28.02 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  28.68 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  31.11 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  25.95 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.23 
 
 
483 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.95 
 
 
484 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  30.48 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  28.29 
 
 
469 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  27.11 
 
 
447 aa  43.1  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.73 
 
 
464 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.31 
 
 
460 aa  43.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>