79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3340 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
481 aa  985    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  72.28 
 
 
470 aa  681    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  63.34 
 
 
455 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.58 
 
 
456 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  59.23 
 
 
452 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  58.73 
 
 
460 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  58.87 
 
 
479 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.72 
 
 
459 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  57.2 
 
 
481 aa  508  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.72 
 
 
459 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  55.72 
 
 
459 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.77 
 
 
460 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.9 
 
 
460 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.3 
 
 
459 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.78 
 
 
463 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  54 
 
 
466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  54.23 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.79 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.8 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  46.82 
 
 
451 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  28.57 
 
 
497 aa  148  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  25.86 
 
 
578 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  31.08 
 
 
491 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  35.43 
 
 
468 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.28 
 
 
463 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
472 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.61 
 
 
462 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  29.03 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  28.12 
 
 
461 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.34 
 
 
453 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.79 
 
 
462 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.95 
 
 
462 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  24.84 
 
 
447 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30.95 
 
 
462 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.95 
 
 
462 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 
456 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  29.37 
 
 
456 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 
456 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.17 
 
 
460 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 
476 aa  53.5  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  29.1 
 
 
473 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.37 
 
 
483 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.45 
 
 
656 aa  50.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  29 
 
 
441 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  29.63 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  32.76 
 
 
442 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  26.72 
 
 
456 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.3 
 
 
464 aa  47  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  29.87 
 
 
447 aa  47  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.22 
 
 
520 aa  46.6  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  28.05 
 
 
352 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  25.86 
 
 
456 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.96 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 
461 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.44 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  30.23 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.95 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 
452 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.87 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11243  FAD/FMN-containing isoamyl alcohol oxidase MreA (AFU_orthologue; AFUA_6G03620)  32.81 
 
 
562 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.549229  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.7 
 
 
475 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  28.96 
 
 
465 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1084  FAD linked oxidase domain protein  32.79 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  30.77 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.3 
 
 
362 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
478 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.65 
 
 
362 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  24.17 
 
 
471 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.46 
 
 
482 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  30.56 
 
 
481 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  27.48 
 
 
457 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.6 
 
 
490 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  27.48 
 
 
457 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  24.56 
 
 
440 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  28.33 
 
 
449 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  29.19 
 
 
432 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.17 
 
 
468 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>