72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0825 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 451 aa  929    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.32 
 
 		 479 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  46.15 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  48.08 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.67 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  46.82 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  41.56 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  42.79 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.39 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.39 
 
 		 460 aa  352  7e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.78 
 
 		 459 aa  343  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.03 
 
 		 463 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.63 
 
 		 459 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.41 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  41.41 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  42.66 
 
 		 481 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.74 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.92 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  41.93 
 
 		 466 aa  325  7e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  43.32 
 
 		 493 aa  325  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  26.42 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  25.69 
 
 		 578 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  33.76 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.09 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.59 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.33 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.57 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  24.82 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  25.56 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.39 
 
 		 472 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  26.22 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  30.33 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  27.34 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  23.84 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  28.09 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  26.06 
 
 		 476 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.75 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.75 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  24.75 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  31.25 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.1 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  29.93 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.34 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  25.19 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 		 481 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.33 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.37 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  26.7 
 
 		 447 aa  47  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  28.49 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  23.62 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  26.43 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  30.47 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.46 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  24.35 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  27.14 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  23.77 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  22.55 
 
 		 489 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11243  FAD/FMN-containing isoamyl alcohol oxidase MreA (AFU_orthologue; AFUA_6G03620)  32.5 
 
 		 562 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.549229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  19.87 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  27.33 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  22.53 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  39.34 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 		 447 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 462 aa  43.5  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.12 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>