175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6373 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  69.66 
 
 		 437 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 448 aa  934    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  55.02 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.46 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.06 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  49.4 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  47.03 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.92 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  47.85 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.86 
 
 		 429 aa  360  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  43.66 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  45.91 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  41.57 
 
 		 418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  43.72 
 
 		 413 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  44.31 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  40.71 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  28.57 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  28.09 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  27.4 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  27.03 
 
 		 438 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  26.16 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  27.03 
 
 		 437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  26.8 
 
 		 437 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 437 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  26.8 
 
 		 437 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  26.98 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  25.86 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  26.77 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  26.76 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  26.74 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  23.84 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  26.13 
 
 		 433 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  24.48 
 
 		 424 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  24.41 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  26.26 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  27.09 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  26.73 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  26.42 
 
 		 473 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  26.58 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  25.06 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.87 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  24.95 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  25.17 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  26.27 
 
 		 452 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  26.23 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  26.19 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  26.71 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  24.84 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  26.15 
 
 		 437 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  25.68 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  24.61 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  26.59 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  24.94 
 
 		 470 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  26.33 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  23.76 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.29 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  25.54 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  24.72 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  24.94 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  25.81 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  23.4 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  31 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  25.36 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  29.5 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  28.28 
 
 		 572 aa  87.4  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  29.26 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  23.31 
 
 		 556 aa  82.8  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  29.8 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  25.13 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  30.23 
 
 		 574 aa  80.1  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  27.59 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  24.54 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  33.67 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.98 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  25.37 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  24.68 
 
 		 761 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  23.37 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  27.48 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  20.7 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  27.75 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.75 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.75 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.37 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  23.37 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.56 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  21.56 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.37 
 
 		 468 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  20.51 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  23.37 
 
 		 478 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  23.37 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.83 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.46 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  22.28 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  23.38 
 
 		 539 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  23.61 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.01 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  22.28 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  20.69 
 
 		 481 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>