More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0499 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 437 aa  889    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  54.4 
 
 		 432 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  52.78 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.26 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  51.36 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.04 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.98 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  51.95 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.73 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.88 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  51.62 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  51.73 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  49.5 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  46.62 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.58 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.27 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.58 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  42.63 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  46.14 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.12 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  44.88 
 
 		 468 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  45.09 
 
 		 444 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  40.58 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  40.58 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  40.3 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.76 
 
 		 444 aa  313  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 		 440 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  38.25 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  44.22 
 
 		 442 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.45 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  44.61 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  43.71 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  42.07 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  40.44 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.13 
 
 		 462 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  40.15 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.71 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  36.88 
 
 		 481 aa  243  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  39.35 
 
 		 455 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  37.35 
 
 		 456 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.35 
 
 		 456 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.35 
 
 		 456 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  37.59 
 
 		 461 aa  230  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.6 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.41 
 
 		 463 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  35.25 
 
 		 474 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  31.62 
 
 		 425 aa  216  7e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  33.94 
 
 		 476 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  34.26 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  33.85 
 
 		 431 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.18 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  27.18 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  27.18 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  27.54 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.18 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.7 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  27.18 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  27.18 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  25.6 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  26.09 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  25.9 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 		 983 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  27.18 
 
 		 993 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  31.45 
 
 		 973 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.74 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  28.97 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1050 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  30.53 
 
 		 1052 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.71 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  31.21 
 
 		 974 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  29.93 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001538  Fe-S oxidoreductase  24.42 
 
 		 1015 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  29.73 
 
 		 578 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  29.3 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.08 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.27 
 
 		 474 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  29.33 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  30.3 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  30 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  28.43 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  31.9 
 
 		 1050 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  32.69 
 
 		 985 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  31.47 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  28.46 
 
 		 499 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  27.21 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  28.68 
 
 		 499 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.25 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.55 
 
 		 470 aa  54.3  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.25 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  28.8 
 
 		 523 aa  53.9  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  35.04 
 
 		 894 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  28.68 
 
 		 492 aa  53.5  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  27.69 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.66 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.48 
 
 		 485 aa  53.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.66 
 
 		 499 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0884  FAD linked oxidase domain protein  27.06 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0923  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.06 
 
 		 477 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0282812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>