More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5664 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
468 aa  954    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.5 
 
 
454 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  52.29 
 
 
481 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  51.01 
 
 
453 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  50.56 
 
 
452 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  50.22 
 
 
456 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.22 
 
 
456 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.22 
 
 
456 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.75 
 
 
472 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.12 
 
 
463 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  48.04 
 
 
461 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  45.09 
 
 
474 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  45.17 
 
 
462 aa  364  2e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  43.59 
 
 
476 aa  355  6.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  41.74 
 
 
452 aa  355  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  40.36 
 
 
443 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.58 
 
 
432 aa  325  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  44.88 
 
 
437 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.06 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  40.94 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  40.1 
 
 
457 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  40.1 
 
 
457 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  37.92 
 
 
430 aa  311  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  40.18 
 
 
464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  40 
 
 
436 aa  297  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.37 
 
 
444 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  41.23 
 
 
432 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  40.98 
 
 
440 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  40.67 
 
 
442 aa  292  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  39.87 
 
 
444 aa  292  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  41.99 
 
 
472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  41.33 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.86 
 
 
440 aa  280  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  42.64 
 
 
438 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  40.64 
 
 
438 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  35.9 
 
 
438 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  38.52 
 
 
432 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.28 
 
 
435 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  41.67 
 
 
438 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  39.95 
 
 
444 aa  266  7e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.48 
 
 
447 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.75 
 
 
437 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.05 
 
 
433 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.88 
 
 
433 aa  260  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  37.05 
 
 
436 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  40.22 
 
 
432 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.59 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  34.34 
 
 
431 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  35.11 
 
 
431 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.75 
 
 
441 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  23.13 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.82 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  30.85 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.04 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  22.38 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  21.95 
 
 
478 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  22.69 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  22.37 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  24.28 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.74 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  22.12 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.89 
 
 
490 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  28.74 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  22.68 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  23.22 
 
 
471 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  22.57 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.44 
 
 
457 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  21.59 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  20.48 
 
 
481 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  29.59 
 
 
441 aa  67  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 
483 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  23.39 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  22 
 
 
423 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.48 
 
 
1023 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.09 
 
 
470 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 
474 aa  62.4  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  30.95 
 
 
473 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.28 
 
 
461 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.42 
 
 
462 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 
378 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.7 
 
 
474 aa  60.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.05 
 
 
473 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  21.71 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
423 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  28.88 
 
 
499 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.13 
 
 
449 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  29.02 
 
 
474 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  29.76 
 
 
474 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.43 
 
 
462 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  31.25 
 
 
578 aa  58.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  20.7 
 
 
448 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  29.41 
 
 
456 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  22.28 
 
 
433 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  29.09 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  21.71 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  29.47 
 
 
495 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.57 
 
 
488 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 
474 aa  57  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>