90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 
462 aa  920    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.8 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  50.32 
 
 
446 aa  423  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  48.66 
 
 
437 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  47.06 
 
 
448 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  49.66 
 
 
418 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  48.12 
 
 
427 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  51.57 
 
 
423 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  49.89 
 
 
421 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  49.32 
 
 
430 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  48.78 
 
 
421 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.31 
 
 
429 aa  360  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.89 
 
 
417 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  43.86 
 
 
424 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  42.5 
 
 
413 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  43.88 
 
 
418 aa  312  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  30.11 
 
 
428 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  30.77 
 
 
441 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  31.37 
 
 
435 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 
437 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  25.79 
 
 
437 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  29.79 
 
 
427 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.94 
 
 
434 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  28.12 
 
 
412 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  25.27 
 
 
437 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  27.08 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  29.94 
 
 
473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  30.87 
 
 
436 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  23.96 
 
 
438 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  24.42 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  31.33 
 
 
433 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  30.5 
 
 
438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  29.31 
 
 
447 aa  134  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  24.79 
 
 
437 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  24.58 
 
 
437 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  27.29 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  32.06 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  24.58 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  24.58 
 
 
437 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  24.58 
 
 
437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  24.58 
 
 
437 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  24.58 
 
 
437 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  29.03 
 
 
425 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  26.69 
 
 
464 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  28.57 
 
 
440 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  29.55 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  25.83 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  31.3 
 
 
452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  26.64 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  27.03 
 
 
439 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  27.29 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  28 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  26.7 
 
 
415 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  26.2 
 
 
469 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  29.07 
 
 
470 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  27.19 
 
 
432 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  27.9 
 
 
439 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  25 
 
 
424 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  27.76 
 
 
475 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  25.52 
 
 
445 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.19 
 
 
445 aa  99.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  29.78 
 
 
466 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.54 
 
 
409 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  37.5 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  25.39 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  32.55 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  32.54 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  24.88 
 
 
556 aa  76.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.75 
 
 
574 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  30.59 
 
 
486 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.66 
 
 
504 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  29.27 
 
 
366 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  29.28 
 
 
572 aa  63.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  26.67 
 
 
478 aa  60.1  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  25.46 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  26.59 
 
 
558 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.32 
 
 
454 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 
376 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.09 
 
 
453 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  26.14 
 
 
425 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  41.38 
 
 
246 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  38.18 
 
 
69 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.47 
 
 
472 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.96 
 
 
433 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  23.23 
 
 
761 aa  43.9  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 
456 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  27.67 
 
 
456 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 
456 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  20 
 
 
443 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>