63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14850 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  100 
 
 
246 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  36.84 
 
 
445 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  35.07 
 
 
439 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  36.16 
 
 
425 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  34.18 
 
 
438 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 
435 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  34.28 
 
 
473 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  35.34 
 
 
437 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  32.87 
 
 
433 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  34.18 
 
 
452 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  35.11 
 
 
437 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  34.32 
 
 
437 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  31.87 
 
 
441 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  33.95 
 
 
432 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  34.07 
 
 
447 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  31.73 
 
 
427 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  33.9 
 
 
486 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  31 
 
 
428 aa  115  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  25.9 
 
 
437 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  30.77 
 
 
438 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  25.9 
 
 
437 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  32.85 
 
 
436 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  24.73 
 
 
437 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  24.73 
 
 
437 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
437 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
437 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  24.73 
 
 
437 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  26.01 
 
 
438 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.68 
 
 
434 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  26.01 
 
 
434 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  24.36 
 
 
437 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  31.93 
 
 
475 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  31 
 
 
470 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  27.56 
 
 
440 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  24.01 
 
 
437 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  28.21 
 
 
424 aa  92  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  25.45 
 
 
460 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  27.54 
 
 
417 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  26.91 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  26.88 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  28.95 
 
 
469 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  25.69 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  27.7 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  25.17 
 
 
466 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  25.29 
 
 
412 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  23.48 
 
 
439 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.54 
 
 
409 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  24.69 
 
 
423 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  42.62 
 
 
411 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  24.81 
 
 
415 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.68 
 
 
429 aa  52  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  21.25 
 
 
478 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  23.66 
 
 
415 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  23.33 
 
 
415 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  38.57 
 
 
418 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 
446 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  52.94 
 
 
430 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.38 
 
 
462 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  44.44 
 
 
421 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.44 
 
 
417 aa  45.4  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.38 
 
 
642 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  38 
 
 
449 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>