104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2301 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 413 aa  830    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  52.06 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  49.64 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.84 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  45.28 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  47.56 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.3 
 
 		 417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  43.72 
 
 		 448 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  45.85 
 
 		 421 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  47.01 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.59 
 
 		 429 aa  338  7e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  47.91 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  45.14 
 
 		 421 aa  332  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  43.49 
 
 		 418 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.5 
 
 		 462 aa  315  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  41.57 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  31.29 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  31.58 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  30.88 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  24.41 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  27.95 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  27.46 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  24.04 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  30.09 
 
 		 438 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  24.55 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  25.48 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  28.95 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  28.37 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.46 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  28.9 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  25.45 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  26.07 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  27.33 
 
 		 473 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  29.84 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  27.59 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  24.72 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  26.32 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  25.59 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  25.12 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  24.88 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  26.37 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  24.48 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  23.36 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  24.41 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  23.95 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  23.95 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  23.95 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 437 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  24.76 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  24.52 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  38.1 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  24.07 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  27.37 
 
 		 447 aa  97.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  27.97 
 
 		 437 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  31.28 
 
 		 460 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.11 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  29.48 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  25.13 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  33.51 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  30.11 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  34.88 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  30.29 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  32.45 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  40.38 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  23.19 
 
 		 556 aa  70.1  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.88 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  29.28 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.37 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  27.23 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  28.12 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  32.8 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  30.56 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2272  hypothetical protein  30.84 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2244  hypothetical protein  29.91 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  31.82 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  28.21 
 
 		 761 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  22.96 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  24.87 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  25.89 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  25.31 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  29.28 
 
 		 456 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 		 456 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 		 456 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.29 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  25 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.53 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0725  hypothetical protein  26.75 
 
 		 584 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.7 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.31 
 
 		 454 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  25.77 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.59 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.86 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.41 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  25.37 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6465  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.79 
 
 		 582 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>