48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6465 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0949  hypothetical protein  55.3 
 
 
595 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0762  FAD binding domain-containing protein  67.66 
 
 
586 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.30819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0751  FAD binding domain-containing protein  67.83 
 
 
586 aa  779    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0929  cholesterol oxidase  67.83 
 
 
586 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10370  hypothetical protein  55.83 
 
 
597 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0619  cholesterol oxidase  69.06 
 
 
645 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6465  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
582 aa  1170    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0725  hypothetical protein  71.75 
 
 
584 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790706  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  27.61 
 
 
437 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  27.61 
 
 
437 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  32.72 
 
 
437 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  32.1 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
437 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
437 aa  65.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  32.72 
 
 
437 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  27.2 
 
 
473 aa  63.9  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  32.1 
 
 
437 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  30.82 
 
 
434 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  29.27 
 
 
437 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  29.56 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  33.33 
 
 
461 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  21.99 
 
 
445 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  28.85 
 
 
437 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  24.49 
 
 
441 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  27 
 
 
436 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  26.77 
 
 
437 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  22.08 
 
 
439 aa  50.8  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  29.67 
 
 
1055 aa  48.9  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  26.03 
 
 
481 aa  48.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  33.17 
 
 
455 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.69 
 
 
490 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  28.47 
 
 
423 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  30.25 
 
 
461 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  25 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  24.79 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  24.19 
 
 
434 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.56 
 
 
448 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.81 
 
 
461 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  27.49 
 
 
469 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  30.07 
 
 
1024 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.12 
 
 
445 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.77 
 
 
417 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.58 
 
 
461 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 
466 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.37 
 
 
453 aa  44.3  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.42 
 
 
448 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  29.52 
 
 
558 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  24.43 
 
 
452 aa  43.5  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>