43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0725 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0762  FAD binding domain-containing protein  63.42 
 
 
586 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.30819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0751  FAD binding domain-containing protein  63.59 
 
 
586 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0929  cholesterol oxidase  63.59 
 
 
586 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0619  cholesterol oxidase  64.44 
 
 
645 aa  778    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0725  hypothetical protein  100 
 
 
584 aa  1195    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790706  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6465  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.75 
 
 
582 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10370  hypothetical protein  53.47 
 
 
597 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0949  hypothetical protein  53.47 
 
 
595 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  29.63 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  28.4 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  29.01 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  28.4 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  28.4 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
437 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  29.63 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  29.01 
 
 
438 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  29.34 
 
 
437 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  27.78 
 
 
437 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  23.52 
 
 
437 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  29.03 
 
 
437 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  25.18 
 
 
473 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 
455 aa  53.9  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  25.69 
 
 
470 aa  53.5  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  22.03 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  27 
 
 
445 aa  52  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  32.14 
 
 
475 aa  52  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  22.52 
 
 
445 aa  51.6  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 
464 aa  51.2  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  28.12 
 
 
428 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  25.87 
 
 
423 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  26.23 
 
 
415 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  26.23 
 
 
415 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  29.93 
 
 
435 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  26.75 
 
 
413 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  26.23 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  26.36 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  24.15 
 
 
452 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.46 
 
 
434 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  26.56 
 
 
441 aa  44.3  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.83 
 
 
429 aa  44.3  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.58 
 
 
1023 aa  43.9  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  24.59 
 
 
460 aa  43.9  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>