39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10370 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_10370  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1220    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0949  hypothetical protein  91.62 
 
 
595 aa  1102    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0762  FAD binding domain-containing protein  56.67 
 
 
586 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.30819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0751  FAD binding domain-containing protein  56.85 
 
 
586 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6465  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.83 
 
 
582 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0725  hypothetical protein  53.47 
 
 
584 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790706  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0619  cholesterol oxidase  55.96 
 
 
645 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0929  cholesterol oxidase  56.85 
 
 
586 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  23.66 
 
 
437 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  23.66 
 
 
437 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  23.66 
 
 
437 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  23.97 
 
 
437 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  23.66 
 
 
437 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  25.27 
 
 
437 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  26.59 
 
 
437 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  27.17 
 
 
437 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  26.7 
 
 
473 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  26.59 
 
 
437 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  26.59 
 
 
438 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  23.08 
 
 
452 aa  55.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  27.27 
 
 
434 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  26.98 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  24.73 
 
 
437 aa  54.3  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  22.25 
 
 
428 aa  52  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  23.51 
 
 
441 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  23.04 
 
 
434 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  24.62 
 
 
469 aa  48.5  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  21.74 
 
 
439 aa  47.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  29.33 
 
 
463 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.67 
 
 
463 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  26.87 
 
 
425 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  26.55 
 
 
442 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  29.01 
 
 
411 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  22.73 
 
 
445 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 
462 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  27.09 
 
 
499 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  25.47 
 
 
423 aa  44.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  29.94 
 
 
558 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  29.25 
 
 
457 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>