26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2272 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2244  hypothetical protein  97.2 
 
 
642 aa  1300    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2272  hypothetical protein  100 
 
 
642 aa  1342    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 
413 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  23.3 
 
 
441 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.77 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  23.91 
 
 
445 aa  54.3  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  23.24 
 
 
556 aa  50.8  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  32.71 
 
 
437 aa  50.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  23.59 
 
 
433 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  25.71 
 
 
432 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  25.9 
 
 
572 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  28.37 
 
 
483 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  29.13 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  23.8 
 
 
470 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  23.84 
 
 
435 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  24.29 
 
 
438 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  23.18 
 
 
469 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  27.93 
 
 
436 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.53 
 
 
429 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  21.84 
 
 
486 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  24.43 
 
 
423 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  23.55 
 
 
437 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  24.52 
 
 
425 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  29.91 
 
 
446 aa  44.3  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  24 
 
 
412 aa  43.9  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  22.63 
 
 
418 aa  43.9  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>