116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0113 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2895  oxidoreductase, FAD-binding, putative  98.55 
 
 		 553 aa  1116    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0685436  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0113  hexose oxidase  100 
 
 		 553 aa  1131    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.258284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3218  oxidoreductase, FAD-binding, putative  89.31 
 
 		 554 aa  977    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3473  putative oxidoreductase, FAD-binding  98.73 
 
 		 553 aa  1118    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1646  putative oxidoreductase, FAD-binding  98.73 
 
 		 553 aa  1118    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3897  FAD/FMN-containing dehydrogenases  99.1 
 
 		 553 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3978  FAD/FMN-containing dehydrogenases  99.45 
 
 		 550 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3077  putative oxidoreductase, FAD-binding  98.73 
 
 		 553 aa  1118    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  54.25 
 
 		 685 aa  555  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  54.43 
 
 		 685 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  54.43 
 
 		 685 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3700  Berberine/berberine domain protein  43.35 
 
 		 508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0050  hypothetical protein  43.04 
 
 		 508 aa  349  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3377  Berberine/berberine domain protein  42.04 
 
 		 508 aa  346  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4988  Berberine/berberine domain protein  38.33 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332344  hitchhiker  0.00488458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4665  Berberine/berberine domain protein  37.19 
 
 		 529 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0997  Berberine/berberine domain-containing protein  29.44 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367258  normal  0.977331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.59 
 
 		 449 aa  97.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.74 
 
 		 490 aa  87.4  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.95 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.48 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  22.5 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.97 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  24.38 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  30.09 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  24.81 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  25.98 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.56 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  22.68 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.12 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  23.78 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  40.54 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  32.63 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.04 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.56 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.27 
 
 		 896 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.05 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.88 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.39 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.59 
 
 		 574 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  32.31 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  26.48 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.94 
 
 		 891 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  30.3 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  24.47 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  28.97 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  24.27 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  25.58 
 
 		 894 aa  60.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  34.76 
 
 		 764 aa  60.5  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  30.84 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.76 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  30.48 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.63 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.77 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.38 
 
 		 864 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.38 
 
 		 864 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08405  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  34.82 
 
 		 596 aa  57  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  24.77 
 
 		 864 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 		 454 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07081  conserved hypothetical protein  31.9 
 
 		 574 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.206599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.42 
 
 		 896 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.42 
 
 		 896 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.24 
 
 		 491 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 		 466 aa  54.7  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 		 444 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  23.87 
 
 		 563 aa  53.5  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  27.83 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  33.58 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.78 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.34 
 
 		 490 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  36.52 
 
 		 459 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  32.86 
 
 		 545 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  30.82 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  30.53 
 
 		 446 aa  52  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  31.85 
 
 		 465 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.23 
 
 		 456 aa  51.2  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02648  isoamyl alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01180)  27.86 
 
 		 566 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.908923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 		 532 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.16 
 
 		 752 aa  50.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 		 481 aa  50.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  23.33 
 
 		 577 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.28 
 
 		 464 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 		 480 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 758 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 		 753 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  26.72 
 
 		 596 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 		 602 aa  47.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 		 477 aa  47  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.05 
 
 		 726 aa  47  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.35 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 465 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  29.26 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.22 
 
 		 445 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>