256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3704 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  100 
 
 		 2334 aa  4691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  42.18 
 
 		 1236 aa  113  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  44.09 
 
 		 1206 aa  111  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  34.16 
 
 		 253 aa  109  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  31.75 
 
 		 264 aa  106  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  30.8 
 
 		 257 aa  103  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  29.77 
 
 		 268 aa  89.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  27.23 
 
 		 245 aa  89  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  28.89 
 
 		 277 aa  87.4  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  31.16 
 
 		 969 aa  87  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  40 
 
 		 1448 aa  86.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  34.39 
 
 		 743 aa  86.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  45.69 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  36.92 
 
 		 2170 aa  84  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  32.35 
 
 		 468 aa  84  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  29.56 
 
 		 260 aa  81.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.36 
 
 		 6885 aa  81.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  28.81 
 
 		 255 aa  80.9  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  37.77 
 
 		 973 aa  80.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  28.23 
 
 		 276 aa  80.1  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  35.57 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  29.91 
 
 		 412 aa  77.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  33.33 
 
 		 803 aa  77.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  37.86 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  27.27 
 
 		 218 aa  76.6  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  27.53 
 
 		 417 aa  76.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  24.67 
 
 		 257 aa  76.3  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  27.13 
 
 		 217 aa  75.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  27.13 
 
 		 417 aa  74.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  32.97 
 
 		 1887 aa  74.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  24.03 
 
 		 249 aa  73.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.36 
 
 		 558 aa  73.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  50 
 
 		 617 aa  73.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  30.37 
 
 		 680 aa  73.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.65 
 
 		 795 aa  73.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  39.53 
 
 		 762 aa  72  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  35.71 
 
 		 474 aa  72.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  46.07 
 
 		 409 aa  72  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  40 
 
 		 14944 aa  71.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  27.41 
 
 		 265 aa  71.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  44.68 
 
 		 552 aa  71.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  27.49 
 
 		 405 aa  70.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  36.45 
 
 		 527 aa  70.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  32.91 
 
 		 1160 aa  70.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.18 
 
 		 3544 aa  70.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 		 776 aa  69.7  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  52.5 
 
 		 608 aa  69.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1200 aa  69.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  25.98 
 
 		 465 aa  69.7  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  26.18 
 
 		 886 aa  68.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  33.52 
 
 		 1199 aa  68.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  27.8 
 
 		 464 aa  68.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  32.67 
 
 		 3699 aa  68.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  50.62 
 
 		 649 aa  67.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  31.11 
 
 		 454 aa  68.6  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  33.82 
 
 		 692 aa  67.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  36.29 
 
 		 569 aa  67.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  39.13 
 
 		 667 aa  67  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  44.57 
 
 		 1213 aa  67  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  29.19 
 
 		 455 aa  66.6  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  29.19 
 
 		 455 aa  66.6  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  38.52 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  42.11 
 
 		 637 aa  66.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.18 
 
 		 3699 aa  65.9  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  28.16 
 
 		 456 aa  65.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  48.28 
 
 		 1121 aa  65.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  30.65 
 
 		 1779 aa  64.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  32.87 
 
 		 564 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.63 
 
 		 11716 aa  64.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  31.69 
 
 		 578 aa  65.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  27.44 
 
 		 455 aa  64.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.92 
 
 		 3802 aa  64.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  26.6 
 
 		 237 aa  63.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  41.76 
 
 		 655 aa  64.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  31.89 
 
 		 445 aa  63.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  36.89 
 
 		 1154 aa  63.9  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.18 
 
 		 3507 aa  63.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  44.19 
 
 		 674 aa  63.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  45.56 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.35 
 
 		 847 aa  63.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  30 
 
 		 1042 aa  63.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.62 
 
 		 729 aa  63.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  31.03 
 
 		 779 aa  62.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  38.75 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  37.78 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  36.27 
 
 		 749 aa  62.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1504 aa  62.8  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  28.04 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  32.61 
 
 		 1050 aa  62  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  40.32 
 
 		 854 aa  62  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  44.94 
 
 		 1137 aa  62.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  35.87 
 
 		 235 aa  62  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  45.74 
 
 		 651 aa  61.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  35.29 
 
 		 660 aa  61.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.76 
 
 		 455 aa  61.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  39.08 
 
 		 685 aa  61.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  39.08 
 
 		 685 aa  61.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  32.32 
 
 		 995 aa  61.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  31.82 
 
 		 326 aa  61.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  39.08 
 
 		 685 aa  61.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>