134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6990 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
276 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  46.7 
 
 
253 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  40.98 
 
 
268 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  38.79 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  38.78 
 
 
405 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  37.04 
 
 
277 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  36.14 
 
 
218 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  35.27 
 
 
417 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  34.82 
 
 
417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  34.56 
 
 
217 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  34.05 
 
 
412 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  31.86 
 
 
245 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  35.55 
 
 
474 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  33.93 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  34.58 
 
 
468 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  33.79 
 
 
255 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  31.2 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  33.82 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  33.49 
 
 
249 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  32.19 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  32.35 
 
 
886 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  43.22 
 
 
326 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  31.25 
 
 
1771 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  32.09 
 
 
217 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  26.83 
 
 
257 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  32.49 
 
 
563 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  28.74 
 
 
325 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  27.35 
 
 
384 aa  95.5  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  31.58 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  28.51 
 
 
257 aa  89  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  28.23 
 
 
2334 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3696  peptidase-like protein  29.82 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  26.36 
 
 
358 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  24.54 
 
 
325 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  28.74 
 
 
452 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  28.74 
 
 
452 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  26.55 
 
 
295 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  28.83 
 
 
446 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  28.33 
 
 
700 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  24.59 
 
 
367 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  27.1 
 
 
795 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.29 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  24.08 
 
 
372 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  28.37 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  26.67 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  32.56 
 
 
777 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  22.03 
 
 
436 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  24.75 
 
 
406 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  26.21 
 
 
752 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  26.21 
 
 
752 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  26.21 
 
 
752 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  25.14 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  33.33 
 
 
816 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  25.98 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2441  putative esterase  27.5 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  22.9 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  23.31 
 
 
414 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  24.29 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  27.1 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  23.26 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  24.34 
 
 
355 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1582  putative esterase  24.02 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  30.7 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  27.41 
 
 
850 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  27.81 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  23.4 
 
 
501 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.61 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  27.67 
 
 
381 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  23.53 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  27.04 
 
 
392 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  23.04 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.57 
 
 
1002 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  26.46 
 
 
314 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
837 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  23 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  48.21 
 
 
816 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.5 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  25.16 
 
 
328 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  25 
 
 
279 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.67 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  28.25 
 
 
324 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  24.88 
 
 
286 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  28.14 
 
 
392 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1483  esterase  26.58 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  22.51 
 
 
314 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  28.38 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  28.38 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  27.71 
 
 
796 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  28.57 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  28.57 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  28.57 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  28.57 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  28.57 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  36 
 
 
363 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  24.64 
 
 
315 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  24.19 
 
 
426 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.34 
 
 
429 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  28.57 
 
 
281 aa  45.4  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  27.69 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>