90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0335 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 357 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  85.39 
 
 		 357 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  77.4 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  64.51 
 
 		 355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  50.28 
 
 		 365 aa  332  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  35.71 
 
 		 263 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  34.08 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  29.82 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  33.16 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  34.5 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  32.12 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  32.64 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  34.1 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  28.36 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  28.36 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  29.28 
 
 		 238 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  31.79 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  27.98 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  31.09 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  30.93 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  25.52 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  25.13 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  31.22 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  25.33 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  29.79 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  26.4 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  28.16 
 
 		 225 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  25.73 
 
 		 886 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  23.7 
 
 		 405 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  29.81 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  27.57 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  28.26 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  32.86 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  30.29 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.88 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  28.1 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  32.08 
 
 		 223 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  34.51 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  31.36 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.47 
 
 		 1002 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.73 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  25.65 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  28.71 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  23.81 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  23.04 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  27.59 
 
 		 306 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  26.86 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  24.04 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.07 
 
 		 222 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  21.51 
 
 		 257 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  26.7 
 
 		 260 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  28.83 
 
 		 221 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.71 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  27.33 
 
 		 219 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  28.07 
 
 		 236 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.79 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.94 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0353  hypothetical protein  26.62 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  28.81 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  28.8 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  24.26 
 
 		 985 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  25.42 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  28.79 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.65 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  27.59 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  28.72 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  29.63 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  26.98 
 
 		 222 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.96 
 
 		 492 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.96 
 
 		 492 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  34.96 
 
 		 492 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  34.96 
 
 		 492 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  34.96 
 
 		 492 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.96 
 
 		 492 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  26.77 
 
 		 222 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  25.13 
 
 		 224 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.58 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  21.97 
 
 		 1771 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.84 
 
 		 677 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  27.27 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  26.34 
 
 		 217 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0686  phospholipase/carboxylesterase  23.03 
 
 		 232 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.25 
 
 		 501 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.15 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  27.27 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  27.68 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  28.19 
 
 		 227 aa  42.7  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.1 
 
 		 619 aa  42.7  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>