95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0548 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 		 358 aa  714    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  77.4 
 
 		 357 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  75.35 
 
 		 357 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  64.79 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  46.99 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  35.05 
 
 		 263 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  32.46 
 
 		 277 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  29.67 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  31.25 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  34.85 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  32.64 
 
 		 239 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  32.12 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  25.91 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  31 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  34.1 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  25.1 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  32.76 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  29.53 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  26.67 
 
 		 886 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  31.79 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  26.94 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  25.65 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  26.36 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  32.69 
 
 		 226 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  30.22 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  30.16 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  31.22 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  28.16 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  33.74 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  26.84 
 
 		 268 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  24.29 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  26.86 
 
 		 225 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  26.4 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  25.33 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  28.71 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  30.6 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  31.48 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  28.18 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3866  hypothetical protein  28.86 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.46 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.93 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  27.21 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  27.27 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0686  phospholipase/carboxylesterase  24.47 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.97 
 
 		 1002 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  25.6 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  23.91 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  23.85 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0353  hypothetical protein  28.47 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.92 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  29.81 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  29.53 
 
 		 237 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  34.07 
 
 		 204 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  34.07 
 
 		 204 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  30.77 
 
 		 226 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  28.46 
 
 		 245 aa  46.6  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  22.22 
 
 		 218 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  25.5 
 
 		 223 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  32.11 
 
 		 220 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  26.79 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  25.13 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.32 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  28.32 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  26.56 
 
 		 217 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  26.32 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  29.82 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  25.95 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.76 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  31.3 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  32.48 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.88 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  25.77 
 
 		 446 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  26.95 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  27.32 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  26.4 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2447  phospholipase/carboxylesterase  22.86 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252523  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  27.93 
 
 		 223 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  27.06 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  24.71 
 
 		 1771 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  28 
 
 		 224 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  27.83 
 
 		 221 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  24.89 
 
 		 468 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.77 
 
 		 286 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  28.7 
 
 		 225 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  34.74 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  32 
 
 		 205 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  23.27 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  24.49 
 
 		 249 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.5 
 
 		 501 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  28.81 
 
 		 217 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  26.67 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.62 
 
 		 279 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  27.52 
 
 		 223 aa  42.7  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>