59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1603 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
328 aa  675    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  52.05 
 
 
446 aa  349  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  51.39 
 
 
452 aa  345  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  51.39 
 
 
452 aa  345  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  28.99 
 
 
417 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  28.99 
 
 
417 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  27.76 
 
 
412 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5656  peptidase-like protein  50 
 
 
162 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  38.75 
 
 
405 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  30.35 
 
 
249 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  26.89 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  23.53 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  27.57 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  31.88 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  27.53 
 
 
260 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  24.06 
 
 
257 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  39.39 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  25.76 
 
 
886 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  25 
 
 
245 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  30.15 
 
 
268 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  28.28 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  29.2 
 
 
217 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.81 
 
 
429 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  29 
 
 
474 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  24.7 
 
 
253 aa  52.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  26.87 
 
 
335 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  26.72 
 
 
243 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  26.21 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  33.33 
 
 
286 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  28.15 
 
 
218 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  27.14 
 
 
394 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  27.18 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  24.61 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  32.2 
 
 
1771 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  23.71 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
563 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  26.02 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  26.02 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  26.02 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  46.2  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  25.71 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  24.63 
 
 
406 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  23.24 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  24.36 
 
 
796 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  25.55 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.75 
 
 
767 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  21.76 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  21.43 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 
237 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  24.44 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  20.45 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04186  dipeptidyl peptidase IV  26.32 
 
 
770 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.804182  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1822  hypothetical protein  27.61 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0613  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.14 
 
 
655 aa  43.5  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  24.29 
 
 
529 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  26.01 
 
 
316 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  23.4 
 
 
317 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  24.44 
 
 
419 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.56 
 
 
344 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>