40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3911 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  100 
 
 		 286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  29.36 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  31.12 
 
 		 1771 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  32.18 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  25.33 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3696  peptidase-like protein  28.7 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  26.13 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  28.63 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  25.23 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  27.11 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  29.85 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.94 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  29.03 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  30.58 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  24.39 
 
 		 563 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  28.29 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  24.88 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  33.58 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  29.03 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  26.47 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  24.68 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  27.96 
 
 		 886 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  24.76 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  32.86 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  32.86 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  22.17 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  27.84 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  22.94 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  28.69 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  25.83 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3665  putative esterase  30.89 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  28.7 
 
 		 474 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  32 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  22.87 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  22.46 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  28.12 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  24.03 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  32.5 
 
 		 795 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  26.58 
 
 		 490 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  27.13 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>