138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4595 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  100 
 
 		 344 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  29.82 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  33.21 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  29.86 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  31.34 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  34.4 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.17 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  33.7 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  34.02 
 
 		 244 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  34.42 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  30.71 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.86 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  33.67 
 
 		 322 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.64 
 
 		 795 aa  92.4  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  27.68 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  28.34 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  32.69 
 
 		 471 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.72 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.56 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  30.83 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.7 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.13 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  30.28 
 
 		 269 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.72 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.47 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  29.89 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.84 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  28.85 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.08 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  34.76 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  34.03 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.33 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.79 
 
 		 1002 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.2 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.22 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.95 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.77 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.38 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  35 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  27.91 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  25.55 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.69 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  26.78 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.9 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  38.02 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  38.2 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.56 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  23.38 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.11 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  30.59 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  30.81 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  25.38 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  27.47 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  33.06 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  27.84 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  33.95 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  39.33 
 
 		 220 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  34.38 
 
 		 279 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  25.43 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  31.85 
 
 		 370 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  29.7 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  27.95 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  38.55 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  24.13 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.33 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.35 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  29.69 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  29.69 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  35.96 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  28.8 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  29.69 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.83 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  32.82 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  27.89 
 
 		 238 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  23 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  34.07 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  24.35 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  35.59 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  38.37 
 
 		 220 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  25 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  32.41 
 
 		 378 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 419 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  25.79 
 
 		 683 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  25.79 
 
 		 683 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  25.68 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  36.47 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  28.4 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  29.03 
 
 		 466 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  25.1 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  33.1 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  33.64 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  29.94 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  28.57 
 
 		 529 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  25.95 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  33.73 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  25.57 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  26.15 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.41 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  24.07 
 
 		 253 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  32.26 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>