182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4027 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 
387 aa  767    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  49.87 
 
 
355 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  47.42 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  55.56 
 
 
414 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  54.48 
 
 
372 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.12 
 
 
429 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  45.64 
 
 
367 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  50.61 
 
 
359 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  46.32 
 
 
422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  45.61 
 
 
422 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  43.42 
 
 
404 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  50.69 
 
 
429 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  51.89 
 
 
419 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  51.89 
 
 
419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  42.72 
 
 
394 aa  272  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  44.19 
 
 
425 aa  272  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  41.04 
 
 
419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  43.8 
 
 
367 aa  262  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  46.6 
 
 
373 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  51.19 
 
 
419 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  51.7 
 
 
438 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  45.69 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  47.28 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  43.72 
 
 
410 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  53.48 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  50 
 
 
416 aa  249  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  51.88 
 
 
411 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  51.09 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  42.56 
 
 
426 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  46.97 
 
 
466 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  42.62 
 
 
544 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  47.4 
 
 
337 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  44.42 
 
 
385 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  44.48 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  45 
 
 
342 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  43.77 
 
 
359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  36.58 
 
 
352 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  39.37 
 
 
369 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  37.32 
 
 
398 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  36.63 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  36.63 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  36.63 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  37.85 
 
 
369 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  35.62 
 
 
433 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  38.31 
 
 
374 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.49 
 
 
364 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.49 
 
 
367 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.49 
 
 
367 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.49 
 
 
382 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.49 
 
 
382 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  35.49 
 
 
382 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  35.49 
 
 
382 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  40.57 
 
 
370 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  41.03 
 
 
357 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.27 
 
 
364 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  31.58 
 
 
334 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  34.4 
 
 
398 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  34.15 
 
 
398 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  39.72 
 
 
369 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  39.72 
 
 
369 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  39.64 
 
 
368 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  39.57 
 
 
343 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  36.36 
 
 
394 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  38.43 
 
 
344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  38.65 
 
 
344 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  38.3 
 
 
355 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.04 
 
 
366 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  38.71 
 
 
363 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  38.97 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  31.94 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  39.86 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  31.67 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  37.23 
 
 
343 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  36.36 
 
 
427 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  35.99 
 
 
427 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  37.37 
 
 
358 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  33.45 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  34.81 
 
 
392 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  37.37 
 
 
358 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  37.23 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  34.04 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  38.57 
 
 
421 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  38.57 
 
 
421 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  34.57 
 
 
392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  34.36 
 
 
419 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  38.93 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  33.73 
 
 
317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  31.97 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2039  PHB depolymerase family esterase  35.07 
 
 
362 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2094  PHB depolymerase family esterase  35.07 
 
 
362 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  33.87 
 
 
331 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31.82 
 
 
529 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  34.32 
 
 
342 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  32.52 
 
 
315 aa  119  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  37.56 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  32.99 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  28.25 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0666  PHB depolymerase family esterase  34.14 
 
 
308 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3281  PHB depolymerase family esterase  34.14 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.123573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3457  PHB depolymerase family esterase  30.85 
 
 
308 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00100534  normal  0.0484591 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>