259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1688 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  68.33 
 
 
221 aa  313  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  69.41 
 
 
221 aa  295  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  64.68 
 
 
219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  64.68 
 
 
220 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  65.14 
 
 
220 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  64.22 
 
 
220 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  47.57 
 
 
224 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  46.34 
 
 
223 aa  171  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  44.91 
 
 
224 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  42.01 
 
 
221 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1900  phospholipase/Carboxylesterase  39.39 
 
 
235 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  44.7 
 
 
227 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  45.75 
 
 
237 aa  154  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  43.28 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  37.56 
 
 
214 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  38.71 
 
 
236 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  41.78 
 
 
222 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  42.31 
 
 
221 aa  134  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3241  phospholipase/carboxylesterase  39.78 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774909  normal  0.296389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  37.75 
 
 
243 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  32.68 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  38.81 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  32.84 
 
 
213 aa  115  5e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  34.26 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  34.16 
 
 
219 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  35.71 
 
 
256 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  32.84 
 
 
198 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5255  phospholipase/Carboxylesterase  31.78 
 
 
213 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  34.3 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  29.17 
 
 
227 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  36.56 
 
 
215 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  31.41 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  35.64 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  30.19 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4181  phospholipase/carboxylesterase  26.96 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  32.51 
 
 
552 aa  82.8  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  31.9 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  28.76 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  30.37 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  34.25 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.91 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  31.98 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  31.1 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  29.72 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  34.64 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  32.11 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  30.85 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  32.04 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  33.85 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  29 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.34 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  29 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  33.71 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  31.75 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  34 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  30.77 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  29.02 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  32.26 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  33.52 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  29.67 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  32.24 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  29.91 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  30 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  29.56 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  30.49 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5017  phospholipase/Carboxylesterase  26.73 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal  0.0411034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  32.61 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  32.8 
 
 
221 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  32.61 
 
 
250 aa  72  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  28.05 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  32.04 
 
 
219 aa  72  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  32.8 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  30.06 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1685  phospholipase/Carboxylesterase  27.59 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0645369  normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  29.5 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0572  phospholipase/Carboxylesterase  34.5 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  30.62 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  27.72 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  28.73 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  31.67 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  32.22 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  28.14 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  26.32 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  33.54 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  30.85 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  31.71 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  30.99 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  26.73 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  32.14 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  25.47 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  30.85 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0434  hypothetical protein  31.69 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0540  phospholipase/carboxylesterase  34 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0982945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  32.6 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  28.83 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  29.59 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>