211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2670 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  100 
 
 
223 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  79.73 
 
 
223 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  73.85 
 
 
223 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  75.12 
 
 
234 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  72.94 
 
 
223 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  72.94 
 
 
223 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  73.85 
 
 
221 aa  340  8e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  72.02 
 
 
223 aa  339  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  71.62 
 
 
229 aa  338  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  74.65 
 
 
221 aa  337  8e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  74.65 
 
 
221 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  72.02 
 
 
226 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  74.18 
 
 
221 aa  333  9e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  71.36 
 
 
222 aa  322  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  67.57 
 
 
224 aa  322  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  64.52 
 
 
226 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  51.12 
 
 
223 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  52.25 
 
 
223 aa  237  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  53.08 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  46.54 
 
 
222 aa  218  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  46.54 
 
 
236 aa  216  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  48.17 
 
 
223 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  46.79 
 
 
227 aa  208  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  47.39 
 
 
231 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  46.05 
 
 
228 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  46.15 
 
 
226 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  46.36 
 
 
222 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  47.25 
 
 
223 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2587  phospholipase/carboxylesterase  78.26 
 
 
124 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000792011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  44.65 
 
 
228 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  44.65 
 
 
228 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  44.65 
 
 
228 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  44.65 
 
 
228 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  44.65 
 
 
228 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  44.65 
 
 
228 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  48.04 
 
 
223 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  43.72 
 
 
319 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  45.75 
 
 
221 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  44.7 
 
 
248 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  43.58 
 
 
222 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  44.75 
 
 
223 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  45.02 
 
 
226 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  45.12 
 
 
223 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  43.58 
 
 
220 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  47.53 
 
 
221 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  45.83 
 
 
225 aa  185  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  41.95 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  40.85 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  43.81 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  44.24 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  44.39 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  46.05 
 
 
219 aa  180  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  42.79 
 
 
220 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3288  carboxylesterase  43.32 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  42.66 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  44.5 
 
 
221 aa  178  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4297  carboxylesterase  44.65 
 
 
232 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  38.71 
 
 
233 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  41.36 
 
 
224 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  40.62 
 
 
224 aa  168  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  44.5 
 
 
219 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  43.58 
 
 
218 aa  167  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  44.76 
 
 
215 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  44.04 
 
 
219 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  43.12 
 
 
219 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  38.57 
 
 
226 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  43.33 
 
 
215 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  37.1 
 
 
224 aa  156  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32853  predicted protein  37.79 
 
 
226 aa  155  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  41.4 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  41.4 
 
 
218 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02430  acyl-protein thioesterase-1, putative  36.32 
 
 
238 aa  152  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  41.4 
 
 
218 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  41.4 
 
 
218 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  40.37 
 
 
219 aa  151  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0035  carboxylesterase  38.25 
 
 
221 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2584  phospholipase/carboxylesterase family protein  66 
 
 
101 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  37.8 
 
 
209 aa  142  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08748  Acyl-protein thioesterase 1 (EC 3.1.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASI2]  38.14 
 
 
239 aa  138  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0434  hypothetical protein  36.06 
 
 
219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  31.8 
 
 
229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83761  predicted protein  36.96 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199859  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0410  hypothetical protein  36.06 
 
 
219 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  33.82 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  34 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  30.97 
 
 
220 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  31.51 
 
 
204 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 
205 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  31.51 
 
 
204 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  28.97 
 
 
223 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  35.35 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  28.71 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  28.64 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33720  predicted protein  31.49 
 
 
260 aa  82  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  30.56 
 
 
227 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  27.15 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  30.4 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  32.04 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  28.57 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>