199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1900 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1900  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
235 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  63.48 
 
 
233 aa  269  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  62.73 
 
 
224 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  63.96 
 
 
227 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  53.85 
 
 
236 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  50.67 
 
 
224 aa  208  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  50 
 
 
223 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  45.98 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  47.16 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  39.39 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  46.08 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3241  phospholipase/carboxylesterase  41.74 
 
 
222 aa  154  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774909  normal  0.296389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  41.98 
 
 
219 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  45.79 
 
 
220 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  45.25 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  45.33 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  40.91 
 
 
221 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  43.56 
 
 
237 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  41.63 
 
 
256 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  42.31 
 
 
220 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  34.09 
 
 
214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  38.33 
 
 
221 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  34.38 
 
 
213 aa  124  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  33.04 
 
 
213 aa  119  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  38.1 
 
 
277 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  34.45 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  36.36 
 
 
219 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  33.17 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  31.4 
 
 
198 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5255  phospholipase/Carboxylesterase  31.4 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  30.96 
 
 
204 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  32.82 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  30.96 
 
 
204 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  29.58 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  27.64 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  29.25 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  28.93 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  32.62 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  31.63 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  28.72 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  31.35 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  28.79 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  32.97 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2604  esterase YpfH  29.35 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2753  esterase YpfH  29.35 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2620  esterase YpfH  29.35 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  29.35 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1203  esterase YpfH  29.35 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176443  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.7 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  30.99 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  28.86 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  30.98 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02365  predicted hydrolase  28.86 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1196  phospholipase/Carboxylesterase  28.86 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02327  hypothetical protein  28.86 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  32.07 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  30.05 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  32.02 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  29.82 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  30.35 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  30.14 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  29.3 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  29.15 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  26.67 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  31.1 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0236  phospholipase/Carboxylesterase  31.19 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  27.92 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  28.77 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0271  esterase  34.94 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  28.37 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  32.12 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  28.25 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  31.18 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  28.5 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  29.19 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1554  esterase YpfH  29.53 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06070  predicted esterase  32.71 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.998593  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  33.51 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  27.92 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  28.32 
 
 
221 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  26.26 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24861  esterase  36.94 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  29.35 
 
 
238 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  31.52 
 
 
233 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  29.56 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  29.7 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0242  esterase  34.91 
 
 
190 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3504  esterase YpfH  26.56 
 
 
229 aa  62  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  27.44 
 
 
223 aa  61.6  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  26.58 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  30.06 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  27.32 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  30.66 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  32.04 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  30.06 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  30.06 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  30.06 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  30.06 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  29.52 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  30.06 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>