252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2728 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 
220 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  99.09 
 
 
220 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  88.18 
 
 
220 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  72.02 
 
 
219 aa  312  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  64.68 
 
 
223 aa  286  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  65.3 
 
 
221 aa  280  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  64.55 
 
 
221 aa  262  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  52.2 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  48.42 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  50.24 
 
 
224 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  39.23 
 
 
214 aa  168  7e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  50 
 
 
237 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  45.71 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  48.61 
 
 
227 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1900  phospholipase/Carboxylesterase  45.79 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  44.76 
 
 
236 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3241  phospholipase/carboxylesterase  44.08 
 
 
222 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774909  normal  0.296389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  49.03 
 
 
221 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  46.04 
 
 
222 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  43.5 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  45.1 
 
 
256 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  42.92 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  41.79 
 
 
277 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  31.71 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  39.11 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5255  phospholipase/Carboxylesterase  38.12 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.68 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  35.68 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 
219 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  33.02 
 
 
221 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  33.15 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  32.24 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  33.16 
 
 
240 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  32.39 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  32.39 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  31.25 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  31.86 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  32.39 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  31.25 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  37.02 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  33.99 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  32.56 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  30.89 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  33.65 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  32.24 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  31.75 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  32.31 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  34.62 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  32.31 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  31.48 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  34.3 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  30.24 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  35.12 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  31.22 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  31.92 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  31.07 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  29.05 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  30.36 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  35.48 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  33.51 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  31.53 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  32.86 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  33.17 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  31.1 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.32 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  31.46 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0236  phospholipase/Carboxylesterase  34.85 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  30.62 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  30.77 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  29.19 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  30.99 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  37.71 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  33.33 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  38.42 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  30.94 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  36.02 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  30.69 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  31.16 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  32.99 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  29.15 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  31.07 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  32.61 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  33.15 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  29.67 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  30.58 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  25.62 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0242  esterase  34.31 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  32.07 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  31.05 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  31.67 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  27.4 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  31.6 
 
 
215 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03451  esterase  30 
 
 
201 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  28.99 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  29.21 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1633  esterase  31.58 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  32.84 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  34.36 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  27.09 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  26.87 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>