195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1130 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  100 
 
 
219 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  94.52 
 
 
219 aa  417  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  65.6 
 
 
277 aa  295  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  38.32 
 
 
223 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  41.87 
 
 
236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  38.69 
 
 
224 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3241  phospholipase/carboxylesterase  38.1 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774909  normal  0.296389 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  37.14 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  36.76 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  39.8 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  35.19 
 
 
223 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  35.15 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  36.49 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  36.32 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  39.71 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1900  phospholipase/Carboxylesterase  35.41 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  36.02 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  39.25 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  32 
 
 
214 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  30.41 
 
 
221 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  37.32 
 
 
221 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  33.99 
 
 
219 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1554  esterase YpfH  36.55 
 
 
241 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3504  esterase YpfH  37.56 
 
 
229 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2753  esterase YpfH  36.68 
 
 
232 aa  101  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  36.68 
 
 
232 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1203  esterase YpfH  36.68 
 
 
232 aa  101  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176443  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2620  esterase YpfH  36.68 
 
 
232 aa  101  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2604  esterase YpfH  36.68 
 
 
232 aa  101  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02365  predicted hydrolase  36.18 
 
 
232 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1196  phospholipase/Carboxylesterase  36.18 
 
 
232 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02327  hypothetical protein  36.18 
 
 
232 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  36.18 
 
 
232 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2979  esterase YpfH  35.68 
 
 
228 aa  98.2  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  34.17 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  33.87 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  33.16 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  37.16 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1077  esterase YpfH  33.17 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.213936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  35.48 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  38.97 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5255  phospholipase/Carboxylesterase  32.57 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  33.87 
 
 
233 aa  92  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  34.87 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  31.55 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  27.14 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  31.43 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  24.62 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  27.7 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  31.84 
 
 
552 aa  72  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1633  esterase  31.28 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  30.05 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  30.05 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  30.05 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  30.05 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  30.05 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  29.47 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03451  esterase  28.43 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  30.05 
 
 
319 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  30.81 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  31.84 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24861  esterase  31.75 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2687  phospholipase/carboxylesterase  28.91 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.398408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  29.44 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  29.59 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  28.43 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  29.05 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  28.78 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0242  esterase  32.43 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  28.57 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  33.53 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  29.78 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7245  phospholipase/Carboxylesterase family protein  36.23 
 
 
117 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  28.5 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  30.65 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  27.94 
 
 
223 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  26.18 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  29.73 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  26.32 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  26.06 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02941  esterase  29.84 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.545653  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  26.11 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  29.47 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  27.78 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  28.65 
 
 
229 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  28 
 
 
222 aa  58.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  27.75 
 
 
238 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  27.89 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1685  phospholipase/Carboxylesterase  27.86 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0645369  normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  28.99 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  25.41 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  32.09 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  27.89 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  28.64 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  25.79 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  23.79 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  25.79 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  25.63 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03001  esterase  27.84 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>