256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3306 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  84.58 
 
 
240 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  56.12 
 
 
238 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  33.48 
 
 
245 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  34.42 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0317  serine esterase  36 
 
 
222 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  33.49 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  33.49 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  30.32 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2954  phospholipase/carboxylesterase  31.96 
 
 
223 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231462  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  33.02 
 
 
223 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  32.24 
 
 
225 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  30 
 
 
224 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  32.14 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2447  phospholipase/carboxylesterase  29.86 
 
 
214 aa  99.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  30.81 
 
 
227 aa  98.6  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2128  phospholipase/carboxylesterase  29.49 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282469  hitchhiker  0.000267211 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  29.8 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  30.29 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2100  phospholipase/Carboxylesterase  27.83 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1614  phospholipase/carboxylesterase  27.83 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  27.69 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  28.97 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  25.93 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3304  phospholipase/Carboxylesterase  29.91 
 
 
225 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06070  predicted esterase  33.33 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.998593  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  27.01 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  35.05 
 
 
221 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2495  phospholipase/carboxylesterase  29.49 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  normal  0.915999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  30.24 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4511  phospholipase/carboxylesterase  27.78 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.642593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  26.94 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  31.91 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  33.16 
 
 
220 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  34.39 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3459  phospholipase/carboxylesterase  27.15 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  0.676516 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  33.51 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.22 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.346189  normal  0.196094 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  27.4 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2054  phospholipase/carboxylesterase  27.32 
 
 
381 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  32.06 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  30.1 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3456  phospholipase/carboxylesterase  25.38 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231793  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3288  carboxylesterase  29.41 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1982  phospholipase/carboxylesterase  26.4 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  30.19 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4300  phospholipase/carboxylesterase  24.75 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4066  phospholipase/carboxylesterase  24.75 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  30.48 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  27 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  28.36 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  28.86 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  25.78 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  29.22 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  29.47 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  27.56 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  31.58 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12720  predicted esterase  28.43 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699828  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  28.89 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  27.44 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  36.89 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34870  predicted esterase  26.9 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  28.16 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  25.7 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0540  phospholipase/carboxylesterase  30.37 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0982945  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0090  putative esterase  30.66 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2593  phospholipase/carboxylesterase  30.72 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2541  phospholipase/carboxylesterase  30.72 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0336  phospholipase/Carboxylesterase  29.81 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  27.54 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  30.56 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  27.05 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  25.6 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1578  phospholipase/Carboxylesterase  26.34 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0604  phospholipase/Carboxylesterase  27.14 
 
 
205 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.417113 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  25.91 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  25.45 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  25.23 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  27.54 
 
 
219 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2499  phospholipase/Carboxylesterase  28.29 
 
 
214 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.982674 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  29 
 
 
552 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  29.17 
 
 
221 aa  62.4  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0305  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 
205 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1341  phospholipase/carboxylesterase  25.37 
 
 
279 aa  62  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.226633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0572  phospholipase/Carboxylesterase  29.86 
 
 
218 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  24.53 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  24.38 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1327  phospholipase/carboxylesterase  26.92 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  26.63 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1364  phospholipase/Carboxylesterase  26.29 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000864483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4181  phospholipase/carboxylesterase  26.94 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0274  phospholipase/Carboxylesterase  28.35 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  30.91 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  23.65 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0451  esterase  27.78 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  29.46 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  25.6 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3345  phospholipase/carboxylesterase family protein  25.12 
 
 
203 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>