228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4377 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 
233 aa  470  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  65.95 
 
 
248 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  64.55 
 
 
220 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  63.01 
 
 
223 aa  288  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  61.82 
 
 
220 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  54.13 
 
 
220 aa  252  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  53.46 
 
 
221 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  54.84 
 
 
223 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  51.82 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  49.77 
 
 
222 aa  218  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  49.77 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  48.86 
 
 
227 aa  210  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  46.48 
 
 
222 aa  206  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  46.48 
 
 
236 aa  205  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  47.73 
 
 
224 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  47.06 
 
 
224 aa  198  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  43.66 
 
 
226 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  47 
 
 
226 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  47 
 
 
319 aa  191  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  47.47 
 
 
228 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  46.95 
 
 
226 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  47.47 
 
 
228 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  47.47 
 
 
228 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  47.47 
 
 
228 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  47.47 
 
 
228 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  48.11 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  46.92 
 
 
228 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  44.19 
 
 
221 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  46.98 
 
 
222 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  46.01 
 
 
219 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  44.65 
 
 
221 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  44.65 
 
 
221 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  43.72 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  43.66 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3288  carboxylesterase  45.87 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  43.11 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  48 
 
 
225 aa  181  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  46.45 
 
 
231 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  42.86 
 
 
223 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  42.59 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  42.86 
 
 
223 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  46.33 
 
 
224 aa  178  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  41.26 
 
 
231 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  43.05 
 
 
250 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  45.33 
 
 
223 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  40.45 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  40.64 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4297  carboxylesterase  43.84 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  43.63 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  42.86 
 
 
223 aa  172  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  38.71 
 
 
223 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0035  carboxylesterase  44.5 
 
 
221 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  39.63 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  40.65 
 
 
221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  43 
 
 
234 aa  164  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0434  hypothetical protein  43.35 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0410  hypothetical protein  43.35 
 
 
219 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  42.36 
 
 
226 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  39.35 
 
 
224 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  40.38 
 
 
222 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  38.97 
 
 
222 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  38.79 
 
 
229 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  42.36 
 
 
221 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  43.2 
 
 
219 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  39.17 
 
 
229 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  42.44 
 
 
218 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  41.78 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  40.69 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  42.44 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  41.74 
 
 
219 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  42.72 
 
 
219 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  42.11 
 
 
215 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  41.95 
 
 
218 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  41.46 
 
 
218 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  43 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  41.15 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  42.29 
 
 
218 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02430  acyl-protein thioesterase-1, putative  34.04 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  41.5 
 
 
193 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32853  predicted protein  35.81 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  37.5 
 
 
209 aa  125  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08748  Acyl-protein thioesterase 1 (EC 3.1.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASI2]  34.1 
 
 
239 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83761  predicted protein  28.97 
 
 
233 aa  106  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199859  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  33.49 
 
 
205 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2587  phospholipase/carboxylesterase  46.22 
 
 
124 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000792011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  34.47 
 
 
212 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  30.19 
 
 
223 aa  91.7  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  31.8 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  31.73 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  30.14 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33720  predicted protein  29.06 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  30.14 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  30.92 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  33.82 
 
 
222 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  32.23 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  29.86 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2584  phospholipase/carboxylesterase family protein  40.21 
 
 
101 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  30.14 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  28.77 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  32.83 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>