210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0551 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  100 
 
 
226 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  49.55 
 
 
222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  49.54 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  49.05 
 
 
248 aa  208  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  48.34 
 
 
220 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  45.79 
 
 
220 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  43.66 
 
 
233 aa  194  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  43.26 
 
 
223 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  42.52 
 
 
221 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  41.59 
 
 
220 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  41.2 
 
 
227 aa  178  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  41.67 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  41.63 
 
 
223 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  38.76 
 
 
223 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  40.64 
 
 
225 aa  168  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  41.2 
 
 
226 aa  168  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  40.19 
 
 
221 aa  168  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  40.19 
 
 
221 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  40.28 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  40.57 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  40.19 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  38.79 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  41.63 
 
 
223 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  38.79 
 
 
226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  37.38 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  40.19 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  41.18 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  41.9 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  37.38 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  39.72 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  41.86 
 
 
234 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  37.17 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  37.38 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  38.57 
 
 
223 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  37.98 
 
 
222 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  36.74 
 
 
225 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  40 
 
 
224 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  38.69 
 
 
222 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  37.26 
 
 
219 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  39.05 
 
 
224 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  37.68 
 
 
250 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  35.44 
 
 
223 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3288  carboxylesterase  35.19 
 
 
222 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  36.49 
 
 
228 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  36.49 
 
 
228 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  36.49 
 
 
228 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  36.49 
 
 
228 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  36.49 
 
 
228 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  35.12 
 
 
223 aa  147  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  35.62 
 
 
319 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  39.15 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  36.02 
 
 
226 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  36.02 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  36.71 
 
 
224 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4297  carboxylesterase  39.62 
 
 
232 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  37.16 
 
 
223 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  33.18 
 
 
222 aa  141  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  35.55 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0035  carboxylesterase  37.5 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  35.89 
 
 
228 aa  137  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  39.44 
 
 
219 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02430  acyl-protein thioesterase-1, putative  37.1 
 
 
238 aa  135  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  37.73 
 
 
219 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  34.83 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0434  hypothetical protein  33.66 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0410  hypothetical protein  33.66 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  36.45 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  35.65 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  35.78 
 
 
218 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  35.78 
 
 
218 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.708757 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08748  Acyl-protein thioesterase 1 (EC 3.1.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASI2]  33.19 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  36.24 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  34.15 
 
 
221 aa  125  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  35.65 
 
 
215 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  33.17 
 
 
229 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  34.86 
 
 
219 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  35.94 
 
 
218 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83761  predicted protein  32.14 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199859  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32853  predicted protein  34.1 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  34.56 
 
 
219 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  34.45 
 
 
209 aa  118  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  35.18 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  35.03 
 
 
193 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2587  phospholipase/carboxylesterase  40.65 
 
 
124 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000792011  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33720  predicted protein  33.33 
 
 
260 aa  92  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  29.19 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  29.56 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  29.56 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  30.1 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  29.6 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  33 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  30.28 
 
 
212 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  30.04 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  28.91 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  27.59 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  29.17 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  28.06 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  31.16 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  28.12 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>