187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1296 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  100 
 
 
218 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  98.62 
 
 
218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  97.25 
 
 
218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  92.66 
 
 
218 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  71.1 
 
 
218 aa  329  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  66.36 
 
 
219 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  63.47 
 
 
219 aa  294  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  62.56 
 
 
219 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  61.93 
 
 
219 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  60.83 
 
 
215 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  60.37 
 
 
215 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  45.66 
 
 
225 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  45.45 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  45.12 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  47.2 
 
 
228 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  44.02 
 
 
223 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3288  carboxylesterase  45.27 
 
 
222 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  43.27 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  41.86 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  41.06 
 
 
231 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  42.92 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  43.26 
 
 
231 aa  161  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  41.33 
 
 
223 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  41.86 
 
 
226 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  44.12 
 
 
222 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  41.83 
 
 
224 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  44.12 
 
 
223 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  43.06 
 
 
223 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  42.36 
 
 
219 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  40.85 
 
 
220 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  41.18 
 
 
222 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  41.12 
 
 
223 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  43.06 
 
 
223 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  44.24 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  43.96 
 
 
248 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  42.59 
 
 
223 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  40.74 
 
 
220 aa  154  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  40.48 
 
 
224 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  41.86 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  41.67 
 
 
223 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  41.4 
 
 
223 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  43.52 
 
 
221 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  41.46 
 
 
224 aa  151  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  39.9 
 
 
226 aa  151  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  43.66 
 
 
221 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  43.66 
 
 
221 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  39.64 
 
 
223 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0434  hypothetical protein  39.62 
 
 
219 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0410  hypothetical protein  39.62 
 
 
219 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  42.72 
 
 
221 aa  148  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4297  carboxylesterase  41.67 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  41.59 
 
 
221 aa  146  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  39.53 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  39.53 
 
 
226 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  37.68 
 
 
225 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  38.28 
 
 
236 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  39.53 
 
 
229 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  38.79 
 
 
226 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  41.95 
 
 
233 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  38.43 
 
 
220 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  37.8 
 
 
222 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  38.35 
 
 
228 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  38.35 
 
 
228 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  38.54 
 
 
319 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  38.35 
 
 
228 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  38.35 
 
 
228 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  38.35 
 
 
228 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  38.35 
 
 
228 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  40 
 
 
226 aa  142  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  38.53 
 
 
234 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  38.32 
 
 
227 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  37.32 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0035  carboxylesterase  38.92 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  35.81 
 
 
222 aa  131  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  35.78 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02430  acyl-protein thioesterase-1, putative  35.19 
 
 
238 aa  121  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  35.27 
 
 
209 aa  119  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  33 
 
 
229 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32853  predicted protein  32.88 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08748  Acyl-protein thioesterase 1 (EC 3.1.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASI2]  32.6 
 
 
239 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  34.29 
 
 
218 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83761  predicted protein  31.82 
 
 
233 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199859  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  34.18 
 
 
193 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2587  phospholipase/carboxylesterase  46.43 
 
 
124 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000792011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  29.41 
 
 
218 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  30.88 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33720  predicted protein  29.92 
 
 
260 aa  89.4  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  30.54 
 
 
222 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  28.23 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  32.84 
 
 
212 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  29.38 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  27.4 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  28.31 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  28.37 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  29.06 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  29.06 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  27.59 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  28.44 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  29.72 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>