163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0789 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  58.67 
 
 		 206 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  48.33 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  44.61 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3504  esterase YpfH  46.31 
 
 		 229 aa  183  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  44.61 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2979  esterase YpfH  47.37 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2753  esterase YpfH  45.59 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  45.1 
 
 		 232 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2604  esterase YpfH  45.1 
 
 		 232 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1203  esterase YpfH  45.1 
 
 		 232 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2620  esterase YpfH  45.1 
 
 		 232 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1077  esterase YpfH  45.26 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.213936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02365  predicted hydrolase  44.61 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1196  phospholipase/Carboxylesterase  44.61 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02327  hypothetical protein  44.61 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  44.12 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  43.14 
 
 		 231 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1554  esterase YpfH  45.13 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  39.67 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  38.92 
 
 		 219 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  38.5 
 
 		 219 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  27.92 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  30.43 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  32.7 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  34.3 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  31.5 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  34.92 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4718  esterase YpfH  34.85 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3967  esterase YpfH  41.07 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  29.65 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  33.84 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02941  esterase  32.2 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.545653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24861  esterase  33.5 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5255  phospholipase/Carboxylesterase  30.57 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  32.83 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  32.28 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  25.26 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  30.5 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  30.81 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  28.08 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  30.3 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  33.01 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  30.85 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  29.95 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  29.26 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  32.45 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  30.61 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  29.44 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  28.16 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  32.16 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7245  phospholipase/Carboxylesterase family protein  37.63 
 
 		 117 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431683  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  31.63 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  26.7 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  26.7 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1633  esterase  30.1 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  27.84 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  25.13 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  24.76 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4511  phospholipase/carboxylesterase  29.78 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.642593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  31.98 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2128  phospholipase/carboxylesterase  28.88 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282469  hitchhiker  0.000267211 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  33.12 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0242  esterase  34.16 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2054  phospholipase/carboxylesterase  32.47 
 
 		 381 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  28.29 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0271  esterase  30.87 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  30.56 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  24.52 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03451  esterase  28.5 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0572  phospholipase/Carboxylesterase  33.12 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  23.96 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  29.21 
 
 		 552 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  28.34 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  23.27 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03001  esterase  24.38 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  26.15 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2100  phospholipase/Carboxylesterase  29.02 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1614  phospholipase/carboxylesterase  29.95 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02901  esterase  24.37 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  25.4 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1685  phospholipase/Carboxylesterase  24.74 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0645369  normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  25.12 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  27.6 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  22.6 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4181  phospholipase/carboxylesterase  25.65 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  27.93 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5284  phospholipase/Carboxylesterase  30.96 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  33.07 
 
 		 563 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0269  putative esterase  24.12 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2447  phospholipase/carboxylesterase  23.89 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5511  phospholipase/Carboxylesterase  23.74 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  31.02 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  25.97 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  24.89 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  23.79 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  29.79 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0451  esterase  31.41 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3092  phospholipase/carboxylesterase  32.32 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0944125  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3781  phospholipase/carboxylesterase  31.22 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.715123 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>