43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3967 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3967  esterase YpfH  100 
 
 
212 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4718  esterase YpfH  76.33 
 
 
207 aa  308  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1554  esterase YpfH  40.28 
 
 
241 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2979  esterase YpfH  32.34 
 
 
228 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3504  esterase YpfH  31.5 
 
 
229 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1077  esterase YpfH  29.95 
 
 
228 aa  98.6  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.213936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1196  phospholipase/Carboxylesterase  30.96 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02365  predicted hydrolase  30.96 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02327  hypothetical protein  30.96 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  30.65 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1203  esterase YpfH  30.96 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176443  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  30.96 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2620  esterase YpfH  30.96 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2604  esterase YpfH  30.96 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2753  esterase YpfH  30.96 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  28.57 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  27.6 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  41.07 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  27.6 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  30.46 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  24.88 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  34.8 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  31.41 
 
 
552 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4181  phospholipase/carboxylesterase  24.72 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  32.4 
 
 
227 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  22.28 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  30.05 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34870  predicted esterase  28.73 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  30.08 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2128  phospholipase/carboxylesterase  29.06 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282469  hitchhiker  0.000267211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  28.7 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1281  phospholipase/Carboxylesterase  29.26 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1685  phospholipase/Carboxylesterase  28.25 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0645369  normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  24.62 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  34.91 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5511  phospholipase/Carboxylesterase  25.28 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  32.04 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  26.62 
 
 
277 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  26.57 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  26.37 
 
 
204 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  26.37 
 
 
204 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24861  esterase  30.68 
 
 
201 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02941  esterase  27.32 
 
 
201 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.545653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>